69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0598 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0598  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  479  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.17906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3051  hypothetical protein  46.19 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  44.8 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4519  methyltransferase-like protein  44.98 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3316  hypothetical protein  44.58 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0032  hypothetical protein  39.48 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  38.63 
 
 		 251 aa  142  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0177  hypothetical protein  37.44 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.683668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3363  hypothetical protein  40.1 
 
 		 210 aa  133  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  33.74 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4274  hypothetical protein  33.07 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0246  methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0687  hypothetical protein  31.84 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4278  hypothetical protein  31.4 
 
 		 254 aa  99.4  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327924  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0629  methyltransferase-like protein  32.52 
 
 		 267 aa  97.1  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0535  hypothetical protein  29.81 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0267  hypothetical protein  31.19 
 
 		 268 aa  82  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000450935  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2682  hypothetical protein  30 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1436  hypothetical protein  30 
 
 		 294 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.710593  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3092  hypothetical protein  30.66 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5854  hypothetical protein  28.98 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03940  predicted O-methyltransferase  28.67 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2291  methyltransferase type 11  28.63 
 
 		 332 aa  72  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.293714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1215  hypothetical protein  30.95 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.63809 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4483  methyltransferase type 12  33.07 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2502  O-methyltransferase  27.16 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1623  hypothetical protein  26.92 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  32.98 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2583  hypothetical protein  26.58 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1216  hypothetical protein  28.57 
 
 		 288 aa  62  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.39056 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03273  hypothetical protein  26.35 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1436  Methyltransferase type 11  33.52 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3094  hypothetical protein  31.16 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1338  Methyltransferase type 11  34.08 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.482498  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2190  hypothetical protein  26.51 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  hitchhiker  0.00103879 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0554  hypothetical protein  25.17 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2108  hypothetical protein  26.57 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0643045  normal  0.737149 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3890  putative methyltransferase  27.52 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1889  hypothetical protein  28.03 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.202516  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1862  hypothetical protein  27.62 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343484  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2450  hypothetical protein  27.45 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2430  hypothetical protein  27.62 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00670242  normal  0.312545 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1731  hypothetical protein  25.94 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1896  hypothetical protein  27.2 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275756  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0635  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  27.38 
 
 		 397 aa  55.8  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1759  hypothetical protein  25.74 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.197699  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5320  methyltransferase-like protein  27.52 
 
 		 332 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0656  methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 280 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  0.351614 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2388  hypothetical protein  25.74 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.307249  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  24.12 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1936  hypothetical protein  25.09 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.83 
 
 		 215 aa  53.9  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2256  hypothetical protein  25.32 
 
 		 270 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2515  methyltransferase type 11  31.28 
 
 		 222 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2525  hypothetical protein  24.64 
 
 		 276 aa  52.8  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.637158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2179  hypothetical protein  24.05 
 
 		 270 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.703673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0667  Methyltransferase type 11  31.55 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0338996 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4188  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 		 278 aa  45.8  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.71 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2818  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.67 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2970  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.67 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.94 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3178  methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.184817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3622  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.932817  normal  0.0502026 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4541  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  37.21 
 
 		 188 aa  42.7  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.39 
 
 		 201 aa  42.4  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0927  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  31.71 
 
 		 283 aa  42.4  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.769745  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>