49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1936 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1936  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  566  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2190  hypothetical protein  64.05 
 
 		 282 aa  331  9e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  hitchhiker  0.00103879 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2583  hypothetical protein  57.41 
 
 		 270 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2108  hypothetical protein  56.41 
 
 		 276 aa  316  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0643045  normal  0.737149 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2179  hypothetical protein  55.93 
 
 		 270 aa  314  8e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.703673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2388  hypothetical protein  55.93 
 
 		 270 aa  311  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.307249  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1862  hypothetical protein  55.72 
 
 		 270 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343484  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2430  hypothetical protein  55.39 
 
 		 270 aa  310  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00670242  normal  0.312545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2256  hypothetical protein  55.56 
 
 		 270 aa  310  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1896  hypothetical protein  54.98 
 
 		 270 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275756  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2450  hypothetical protein  54.91 
 
 		 276 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1889  hypothetical protein  54.98 
 
 		 270 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.202516  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2525  hypothetical protein  55.07 
 
 		 276 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.637158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1731  hypothetical protein  59.76 
 
 		 287 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1759  hypothetical protein  55.26 
 
 		 270 aa  301  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.197699  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1623  hypothetical protein  57.37 
 
 		 289 aa  293  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03273  hypothetical protein  54.92 
 
 		 284 aa  252  6e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0554  hypothetical protein  47.93 
 
 		 282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2291  methyltransferase type 11  54.73 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.293714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3890  putative methyltransferase  51.02 
 
 		 285 aa  236  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3092  hypothetical protein  47.67 
 
 		 278 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5320  methyltransferase-like protein  49.8 
 
 		 332 aa  232  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0629  methyltransferase-like protein  51 
 
 		 267 aa  229  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03940  predicted O-methyltransferase  46.07 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1216  hypothetical protein  49.06 
 
 		 288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.39056 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2682  hypothetical protein  49.57 
 
 		 298 aa  217  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1436  hypothetical protein  49.57 
 
 		 294 aa  215  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.710593  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5854  hypothetical protein  47.79 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0267  hypothetical protein  45.14 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000450935  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2502  O-methyltransferase  45.98 
 
 		 310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4483  methyltransferase type 12  39.84 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1215  hypothetical protein  44.98 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.63809 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3094  hypothetical protein  37.39 
 
 		 284 aa  132  9e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0535  hypothetical protein  36.43 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4278  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327924  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  27.31 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0032  hypothetical protein  27.73 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3051  hypothetical protein  29.2 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  26.48 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  26.74 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0177  hypothetical protein  27.76 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.683668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4274  hypothetical protein  24.58 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3316  hypothetical protein  25.78 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4519  methyltransferase-like protein  27.17 
 
 		 258 aa  53.1  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0246  methyltransferase type 11  23.81 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0687  hypothetical protein  24.51 
 
 		 249 aa  50.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0598  hypothetical protein  25.21 
 
 		 247 aa  48.9  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.17906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  27.67 
 
 		 184 aa  47  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  21.43 
 
 		 397 aa  42.7  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>