44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3094 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3094  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  572  1.0000000000000001e-162  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1436  hypothetical protein  42.25 
 
 		 294 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.710593  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2682  hypothetical protein  41.5 
 
 		 298 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03273  hypothetical protein  38.73 
 
 		 284 aa  166  5e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2108  hypothetical protein  37.41 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0643045  normal  0.737149 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5854  hypothetical protein  39.51 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2450  hypothetical protein  34.95 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0554  hypothetical protein  38.97 
 
 		 282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0629  methyltransferase-like protein  39.6 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2190  hypothetical protein  34.42 
 
 		 282 aa  142  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  hitchhiker  0.00103879 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1936  hypothetical protein  35.63 
 
 		 276 aa  142  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2502  O-methyltransferase  34.62 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1623  hypothetical protein  33.22 
 
 		 289 aa  139  6e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5320  methyltransferase-like protein  39.17 
 
 		 332 aa  139  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2291  methyltransferase type 11  39.83 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.293714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2430  hypothetical protein  33.22 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00670242  normal  0.312545 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1889  hypothetical protein  33.22 
 
 		 270 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.202516  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2583  hypothetical protein  34.63 
 
 		 270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0267  hypothetical protein  35.25 
 
 		 268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000450935  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1731  hypothetical protein  33.56 
 
 		 287 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1862  hypothetical protein  32.98 
 
 		 270 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343484  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1896  hypothetical protein  32.63 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275756  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3890  putative methyltransferase  37.4 
 
 		 285 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1759  hypothetical protein  33.09 
 
 		 270 aa  132  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.197699  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03940  predicted O-methyltransferase  34.15 
 
 		 284 aa  132  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4483  methyltransferase type 12  34.94 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3092  hypothetical protein  34.66 
 
 		 278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2388  hypothetical protein  33.46 
 
 		 270 aa  129  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.307249  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2525  hypothetical protein  32.51 
 
 		 276 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.637158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1216  hypothetical protein  35.52 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.39056 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2179  hypothetical protein  31.52 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.703673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2256  hypothetical protein  33.07 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1215  hypothetical protein  35.74 
 
 		 280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.63809 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  32.84 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0535  hypothetical protein  48.08 
 
 		 254 aa  72  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4278  hypothetical protein  25.96 
 
 		 254 aa  68.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327924  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0598  hypothetical protein  30.08 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.17906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  27.17 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3051  hypothetical protein  27.97 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4519  methyltransferase-like protein  28.32 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0032  hypothetical protein  26.54 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0177  hypothetical protein  46.94 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.683668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4274  hypothetical protein  44 
 
 		 262 aa  43.5  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>