48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2430 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2430  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00670242  normal  0.312545 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1896  hypothetical protein  98.15 
 
 
270 aa  550  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275756  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1862  hypothetical protein  97.78 
 
 
270 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343484  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1889  hypothetical protein  97.78 
 
 
270 aa  547  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.202516  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1759  hypothetical protein  86.62 
 
 
270 aa  498  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.197699  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2256  hypothetical protein  85.13 
 
 
270 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2388  hypothetical protein  85.13 
 
 
270 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.307249  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2583  hypothetical protein  84.39 
 
 
270 aa  489  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2179  hypothetical protein  84.39 
 
 
270 aa  485  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.703673  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2450  hypothetical protein  60.14 
 
 
276 aa  348  7e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1623  hypothetical protein  60.71 
 
 
289 aa  346  2e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2108  hypothetical protein  60.07 
 
 
276 aa  345  4e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0643045  normal  0.737149 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2525  hypothetical protein  59.34 
 
 
276 aa  332  3e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.637158  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1731  hypothetical protein  62 
 
 
287 aa  328  8e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2190  hypothetical protein  59.92 
 
 
282 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  hitchhiker  0.00103879 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1936  hypothetical protein  55.39 
 
 
276 aa  310  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03273  hypothetical protein  51.61 
 
 
284 aa  252  4.0000000000000004e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3092  hypothetical protein  48.7 
 
 
278 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3890  putative methyltransferase  46.12 
 
 
285 aa  227  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5320  methyltransferase-like protein  45.53 
 
 
332 aa  221  7e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232499  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03940  predicted O-methyltransferase  42.96 
 
 
284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0554  hypothetical protein  43.01 
 
 
282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2682  hypothetical protein  43.43 
 
 
298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4483  methyltransferase type 12  41.11 
 
 
290 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2291  methyltransferase type 11  48.35 
 
 
332 aa  211  7e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.293714  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0267  hypothetical protein  44.69 
 
 
268 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000450935  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0629  methyltransferase-like protein  45.93 
 
 
267 aa  210  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1436  hypothetical protein  43.82 
 
 
294 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.710593  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5854  hypothetical protein  45.31 
 
 
293 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1216  hypothetical protein  43.53 
 
 
288 aa  202  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.39056 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2502  O-methyltransferase  43.92 
 
 
310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1215  hypothetical protein  43.6 
 
 
280 aa  173  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.63809 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3094  hypothetical protein  34.14 
 
 
284 aa  123  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4278  hypothetical protein  28.72 
 
 
254 aa  106  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327924  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0535  hypothetical protein  32.63 
 
 
254 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  31.28 
 
 
281 aa  78.2  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4274  hypothetical protein  28.42 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  23.9 
 
 
251 aa  62.8  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0032  hypothetical protein  25.1 
 
 
250 aa  61.2  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  22.02 
 
 
241 aa  60.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3051  hypothetical protein  27.8 
 
 
267 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195507  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0177  hypothetical protein  27.43 
 
 
260 aa  57.4  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.683668  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3316  hypothetical protein  25.31 
 
 
262 aa  54.3  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0687  hypothetical protein  24.3 
 
 
249 aa  52  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0598  hypothetical protein  27.8 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.17906  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4519  methyltransferase-like protein  25.33 
 
 
258 aa  50.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148177  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0246  methyltransferase type 11  24.26 
 
 
201 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  25 
 
 
397 aa  43.5  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>