51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3316 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3316  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  526  1e-148  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3051  hypothetical protein  50.67 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0032  hypothetical protein  41.52 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0598  hypothetical protein  45.33 
 
 		 247 aa  160  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.17906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  39.38 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4519  methyltransferase-like protein  39.15 
 
 		 258 aa  148  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  37.99 
 
 		 251 aa  142  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3363  hypothetical protein  37.68 
 
 		 210 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0687  hypothetical protein  32.64 
 
 		 249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0177  hypothetical protein  32.22 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.683668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4274  hypothetical protein  33.09 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0535  hypothetical protein  33.2 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  32.3 
 
 		 241 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0246  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 201 aa  102  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4278  hypothetical protein  28.69 
 
 		 254 aa  95.1  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327924  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2291  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 332 aa  79  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.293714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0629  methyltransferase-like protein  29.17 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3092  hypothetical protein  27.11 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1436  hypothetical protein  27.82 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.710593  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0554  hypothetical protein  30.12 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0267  hypothetical protein  27.27 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000450935  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1216  hypothetical protein  26.36 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.39056 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1215  hypothetical protein  28.74 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.63809 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2682  hypothetical protein  27.82 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5854  hypothetical protein  28.09 
 
 		 293 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1936  hypothetical protein  26.91 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2190  hypothetical protein  27.17 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  hitchhiker  0.00103879 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1623  hypothetical protein  28.27 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4483  methyltransferase type 12  29.62 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1759  hypothetical protein  25.66 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.197699  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03940  predicted O-methyltransferase  25.61 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03273  hypothetical protein  28.52 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2583  hypothetical protein  25.62 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2179  hypothetical protein  26.98 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.703673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2256  hypothetical protein  26.38 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2450  hypothetical protein  27.23 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2388  hypothetical protein  25.51 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.307249  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2430  hypothetical protein  25.31 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00670242  normal  0.312545 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2502  O-methyltransferase  26.74 
 
 		 310 aa  53.5  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1731  hypothetical protein  25.39 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1889  hypothetical protein  25.31 
 
 		 270 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.202516  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3890  putative methyltransferase  29.57 
 
 		 285 aa  53.1  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1896  hypothetical protein  24.9 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275756  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1862  hypothetical protein  24.9 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343484  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5320  methyltransferase-like protein  25.1 
 
 		 332 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2525  hypothetical protein  28.43 
 
 		 276 aa  48.9  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.637158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1003  methyltransferase type 11  40.85 
 
 		 180 aa  46.6  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00822165  normal  0.0267075 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3622  methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 243 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.932817  normal  0.0502026 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  21.65 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0330  methyltransferase type 11  47.06 
 
 		 199 aa  42.4  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>