More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1003 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1003  methyltransferase type 11  100 
 
 		 180 aa  357  6e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00822165  normal  0.0267075 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2692  Methyltransferase type 11  45.9 
 
 		 190 aa  171  5e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  32 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.54 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.4 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1867  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000037556  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1509  Methyltransferase type 11  40.82 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0861  putative methyltransferase  38.75 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000766144  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  36.54 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3189  methyltransferase type 11  29.11 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  30.43 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  36.44 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.56 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0330  methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.79 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.76 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.97 
 
 		 277 aa  58.5  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 267 aa  57.4  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.93 
 
 		 201 aa  57  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.43 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 245 aa  57  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 203 aa  57  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 411 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  36.72 
 
 		 409 aa  55.8  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0799  methyltransferase type 11  38.75 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.14 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  33.33 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2422  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  34.17 
 
 		 295 aa  55.1  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  37.84 
 
 		 1014 aa  54.7  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2791  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.73 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.61 
 
 		 276 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  34.58 
 
 		 268 aa  55.1  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 252 aa  54.3  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2671  SAM-dependent methyltransferase  37.04 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  35.42 
 
 		 266 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.55 
 
 		 272 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1157  methyltransferase type 11  42.03 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120807  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2738  biotin synthesis protein BioC  32 
 
 		 275 aa  52.4  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  31.78 
 
 		 168 aa  52.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.26 
 
 		 273 aa  52.4  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 281 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2357  biotin biosynthesis protein BioC  32 
 
 		 275 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  34.19 
 
 		 355 aa  52.4  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.97 
 
 		 271 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4099  methyltransferase type 11  35.87 
 
 		 248 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2429  biotin biosynthesis protein BioC  32 
 
 		 275 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0131748 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  30.66 
 
 		 237 aa  52  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 264 aa  52  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 284 aa  52  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4175  methyltransferase type 11  35.87 
 
 		 248 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39627  predicted protein  25.84 
 
 		 410 aa  51.6  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.23 
 
 		 268 aa  51.6  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  32.59 
 
 		 271 aa  51.2  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 279 aa  51.6  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 215 aa  51.6  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4330  methyltransferase type 11  35.48 
 
 		 248 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.510233  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 262 aa  51.2  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 		 272 aa  51.2  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  37.11 
 
 		 259 aa  51.2  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3113  Methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 350 aa  51.2  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00520497  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 244 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0543  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 247 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  38.32 
 
 		 273 aa  50.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0896  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 350 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4839  putative methyltransferase  32.65 
 
 		 271 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  38 
 
 		 285 aa  50.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 239 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  30.51 
 
 		 206 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.71 
 
 		 279 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.65 
 
 		 215 aa  49.7  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0189  Methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  39.22 
 
 		 273 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  28.04 
 
 		 274 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2517  biotin biosynthesis protein BioC  32 
 
 		 275 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000257486 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  36.73 
 
 		 264 aa  49.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1037  methyltransferase type 12  43.28 
 
 		 256 aa  49.3  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  33.62 
 
 		 265 aa  48.9  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  37.65 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2043  methyltransferase type 11  41.49 
 
 		 249 aa  48.9  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 206 aa  48.5  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3557  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 369 aa  48.5  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1894  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  41.07 
 
 		 203 aa  48.5  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  32.62 
 
 		 275 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 270 aa  48.1  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.08 
 
 		 270 aa  48.1  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  29.33 
 
 		 246 aa  48.1  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  37.63 
 
 		 201 aa  48.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 286 aa  48.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>