29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3363 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3363  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  430  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3051  hypothetical protein  39.02 
 
 		 267 aa  149  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  39.81 
 
 		 281 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0598  hypothetical protein  40.1 
 
 		 247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.17906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0032  hypothetical protein  41.95 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3316  hypothetical protein  37.68 
 
 		 262 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4519  methyltransferase-like protein  35.75 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  35.24 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4274  hypothetical protein  33.33 
 
 		 262 aa  102  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0177  hypothetical protein  32.7 
 
 		 260 aa  92.8  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.683668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0246  methyltransferase type 11  28.92 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0687  hypothetical protein  31.71 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0535  hypothetical protein  29.17 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4278  hypothetical protein  27.64 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327924  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  30.06 
 
 		 252 aa  52.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0554  hypothetical protein  24.32 
 
 		 282 aa  48.5  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  26.79 
 
 		 397 aa  48.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3092  hypothetical protein  25 
 
 		 278 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1338  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 		 244 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.482498  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.23 
 
 		 279 aa  45.1  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0629  methyltransferase-like protein  24.67 
 
 		 267 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1436  Methyltransferase type 11  28.15 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3890  putative methyltransferase  25.99 
 
 		 285 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1436  hypothetical protein  24.36 
 
 		 294 aa  42  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.710593  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13050  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  60 
 
 		 490 aa  42  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00461265  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 298 aa  42  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3622  methyltransferase type 11  29.88 
 
 		 243 aa  41.6  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.932817  normal  0.0502026 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>