160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0687 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0687  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  499  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0177  hypothetical protein  45.58 
 
 		 260 aa  178  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.683668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  38.5 
 
 		 241 aa  168  8e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4274  hypothetical protein  41.11 
 
 		 262 aa  158  8e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0246  methyltransferase type 11  40.61 
 
 		 201 aa  156  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  40 
 
 		 251 aa  155  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4519  methyltransferase-like protein  32.14 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  33.8 
 
 		 281 aa  135  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3051  hypothetical protein  36 
 
 		 267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0032  hypothetical protein  35.71 
 
 		 250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3316  hypothetical protein  31.82 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0598  hypothetical protein  31.94 
 
 		 247 aa  99  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.17906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3363  hypothetical protein  31.71 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3092  hypothetical protein  28.23 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0667  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0338996 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2291  methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.293714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4278  hypothetical protein  26.07 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327924  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3622  methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.932817  normal  0.0502026 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0635  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0656  methyltransferase type 11  27.81 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  0.351614 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2190  hypothetical protein  29.68 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  hitchhiker  0.00103879 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  32.16 
 
 		 199 aa  62  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3178  methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.184817 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03940  predicted O-methyltransferase  26.72 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0542  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0267  hypothetical protein  25.91 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000450935  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.75 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.205211 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3763  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.66 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0535  hypothetical protein  24 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.03 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.83 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179927  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2313  generic methyltransferase  32.2 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0714275  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3945  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.16 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0271  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.16 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3792  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.58 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.16 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1623  hypothetical protein  27.24 
 
 		 289 aa  57  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66900  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.95 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2996  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.82 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5802  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.95 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0323  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  30.95 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  26.06 
 
 		 397 aa  55.5  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4146  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.75 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5274  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.75 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.123369  normal  0.211011 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4175  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.75 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4297  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.75 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4357  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.75 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.75 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.962772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.75 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4216  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.75 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227535 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0224  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  28.87 
 
 		 317 aa  55.5  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4250  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.75 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3469  Methyltransferase type 11  24.18 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.508961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4057  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.75 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4354  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.75 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.556022  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4305  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.75 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0226  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  28.87 
 
 		 317 aa  55.5  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0629  methyltransferase-like protein  25.51 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.884964 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.75 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0294  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  29.55 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00915266  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  27.74 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.74 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0387  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.78 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4209  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  31.82 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03675  hypothetical protein  31.75 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3373  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.58 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1889  hypothetical protein  25.23 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.202516  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.28 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5061  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.03 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2700  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  27.93 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0698  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  28.18 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3551  demethylmenaquinone methyltransferase  30.99 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0405  demethylmenaquinone methyltransferase  30.99 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.403287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3725  demethylmenaquinone methyltransferase  30.99 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0454  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.03 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0799871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.87 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1896  hypothetical protein  25.23 
 
 		 270 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275756  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4199  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  30.28 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3915  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.16 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2450  hypothetical protein  24.07 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 208 aa  53.1  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1759  hypothetical protein  23.87 
 
 		 270 aa  53.1  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.197699  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2583  hypothetical protein  26.76 
 
 		 270 aa  52.8  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4483  methyltransferase type 12  25.35 
 
 		 290 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3960  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.95 
 
 		 251 aa  52.8  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 273 aa  52.4  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2525  hypothetical protein  26.73 
 
 		 276 aa  52.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.637158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2430  hypothetical protein  24.3 
 
 		 270 aa  52  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00670242  normal  0.312545 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1862  hypothetical protein  24.77 
 
 		 270 aa  52  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343484  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0506  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.17 
 
 		 251 aa  52  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5011  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.27 
 
 		 256 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0445  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.58 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2179  hypothetical protein  25.23 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.703673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3895  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.58 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.4649  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4885  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.27 
 
 		 256 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.58 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0431  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.58 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159062  hitchhiker  0.0000667 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0461  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  28.17 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3202  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  28.87 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>