More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0667 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0667  Methyltransferase type 11  100 
 
 
243 aa  482  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0338996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0656  methyltransferase type 11  96.71 
 
 
280 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  0.351614 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0635  Methyltransferase type 11  91.56 
 
 
244 aa  413  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3622  methyltransferase type 11  75.12 
 
 
243 aa  295  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.932817  normal  0.0502026 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3178  methyltransferase type 11  48.31 
 
 
239 aa  186  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.184817 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2313  generic methyltransferase  48.36 
 
 
252 aa  169  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0714275  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2150  methyltransferase type 11  31.98 
 
 
255 aa  98.6  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.301161  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0768  Methyltransferase type 11  33.72 
 
 
276 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 
397 aa  92.8  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4188  Methyltransferase type 11  36.44 
 
 
278 aa  92.8  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4679  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 
251 aa  91.7  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  32.53 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3469  Methyltransferase type 11  37.17 
 
 
243 aa  89  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.508961  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  37.1 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  32.16 
 
 
281 aa  75.9  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 
208 aa  74.7  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2395  Methyltransferase type 11  32.45 
 
 
208 aa  72  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000965249  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  37.7 
 
 
217 aa  72  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1251  Methyltransferase type 11  25.81 
 
 
216 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000494899  normal  0.377886 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1436  Methyltransferase type 11  35.65 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1338  Methyltransferase type 11  35.65 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.482498  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0687  hypothetical protein  28.99 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2515  methyltransferase type 11  33.59 
 
 
222 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2622  Methyltransferase type 11  27.52 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.179692  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  24.41 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  38.96 
 
 
277 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.14 
 
 
277 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  30.32 
 
 
265 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.14 
 
 
280 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0557  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
206 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  32.45 
 
 
241 aa  62  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  31.97 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  32.2 
 
 
246 aa  61.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  29.49 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  31.53 
 
 
184 aa  59.7  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
190 aa  58.9  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.91 
 
 
283 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  32.2 
 
 
262 aa  57.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.92 
 
 
276 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  29.66 
 
 
209 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0246  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
201 aa  57  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.93 
 
 
271 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0591  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 
263 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.812194 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0600  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
218 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.93996  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04271  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25 
 
 
233 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  25.2 
 
 
267 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.66 
 
 
270 aa  56.2  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  30 
 
 
267 aa  56.2  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.81 
 
 
266 aa  55.8  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1330  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.44 
 
 
205 aa  55.8  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.283996  normal  0.0130791 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0017  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 
191 aa  55.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  35.14 
 
 
279 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  33.86 
 
 
202 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  28.82 
 
 
305 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
281 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2645  methyltransferase type 11  30.51 
 
 
262 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75506  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  42.17 
 
 
409 aa  54.3  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0289  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  33.63 
 
 
261 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 
241 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0466  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.63 
 
 
261 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.2 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0645  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  29.32 
 
 
266 aa  53.5  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0558  Methyltransferase type 11  22.64 
 
 
188 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166016  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00700  conserved hypothetical protein  28 
 
 
239 aa  53.1  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 
295 aa  53.1  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2748  methyltransferase type 11  34.15 
 
 
221 aa  53.1  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
263 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  25.22 
 
 
273 aa  52.8  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.36 
 
 
265 aa  52.8  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2245  Methyltransferase type 11  31.91 
 
 
197 aa  52.8  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.24 
 
 
273 aa  52.4  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  27.54 
 
 
267 aa  52.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  27.17 
 
 
251 aa  52.4  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0177  hypothetical protein  28.99 
 
 
260 aa  52.4  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.683668  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.2 
 
 
287 aa  52  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2816  methyltransferase type 11  30.09 
 
 
236 aa  52  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.218226  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1867  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
186 aa  51.6  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000037556  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  32 
 
 
263 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1433  methyltransferase type 11  25.98 
 
 
190 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  35 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2339  methyltransferase type 11  30.84 
 
 
191 aa  51.6  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.755854  normal  0.422901 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  32.71 
 
 
355 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04625  arsenic methyltransferase Cyt19, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G15020)  29.91 
 
 
282 aa  50.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2791  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.36 
 
 
266 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  31.86 
 
 
273 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7199  methyltransferase type 11  32.8 
 
 
278 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375023  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2029  Methyltransferase type 12  30.22 
 
 
215 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1468  Methyltransferase type 11  34.96 
 
 
237 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  27.68 
 
 
268 aa  50.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2464  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
187 aa  50.1  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788915  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  29.48 
 
 
209 aa  50.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1157  methyltransferase type 11  25.69 
 
 
187 aa  50.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120807  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0330  methyltransferase type 11  32.26 
 
 
199 aa  49.7  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  29.36 
 
 
268 aa  49.7  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1509  Methyltransferase type 11  25.45 
 
 
186 aa  49.3  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  31.9 
 
 
305 aa  49.3  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2376  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  28.45 
 
 
277 aa  49.3  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3189  methyltransferase type 11  27.5 
 
 
187 aa  49.3  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>