142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0246 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0246  methyltransferase type 11  100 
 
 		 201 aa  413  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  58.79 
 
 		 241 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  60.1 
 
 		 251 aa  249  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0687  hypothetical protein  40.61 
 
 		 249 aa  156  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4274  hypothetical protein  37.32 
 
 		 262 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  37.5 
 
 		 281 aa  135  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0177  hypothetical protein  37.93 
 
 		 260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.683668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0032  hypothetical protein  36.32 
 
 		 250 aa  120  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0598  hypothetical protein  34.78 
 
 		 247 aa  119  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.17906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3051  hypothetical protein  34 
 
 		 267 aa  108  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4519  methyltransferase-like protein  28.86 
 
 		 258 aa  105  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3316  hypothetical protein  33.33 
 
 		 262 aa  99  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3363  hypothetical protein  28.92 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5320  methyltransferase-like protein  29.07 
 
 		 332 aa  75.9  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232499  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3092  hypothetical protein  28.19 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0629  methyltransferase-like protein  27.7 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4278  hypothetical protein  30.39 
 
 		 254 aa  68.2  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327924  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03940  predicted O-methyltransferase  26.32 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1436  hypothetical protein  27.19 
 
 		 294 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.710593  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0535  hypothetical protein  26.34 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2682  hypothetical protein  26.32 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0554  hypothetical protein  23.87 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0656  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  0.351614 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0635  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0667  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0338996 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2190  hypothetical protein  24.89 
 
 		 282 aa  57  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  hitchhiker  0.00103879 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3178  methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.184817 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0267  hypothetical protein  25 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000450935  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2502  O-methyltransferase  23.61 
 
 		 310 aa  55.1  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4483  methyltransferase type 12  26.55 
 
 		 290 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3469  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 243 aa  54.7  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.508961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3622  methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.932817  normal  0.0502026 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1623  hypothetical protein  25.22 
 
 		 289 aa  53.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3763  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.41 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1215  hypothetical protein  27.42 
 
 		 280 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.63809 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 		 397 aa  53.9  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03273  hypothetical protein  23.71 
 
 		 284 aa  52.8  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5854  hypothetical protein  26.55 
 
 		 293 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2450  hypothetical protein  24.78 
 
 		 276 aa  52.4  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2108  hypothetical protein  23.45 
 
 		 276 aa  52  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0643045  normal  0.737149 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1216  hypothetical protein  24.36 
 
 		 288 aa  51.6  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.39056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  23.9 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0542  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  31.15 
 
 		 261 aa  50.8  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1731  hypothetical protein  24.56 
 
 		 287 aa  50.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1936  hypothetical protein  23.81 
 
 		 276 aa  50.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1889  hypothetical protein  25.55 
 
 		 270 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.202516  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1896  hypothetical protein  24.68 
 
 		 270 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275756  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  22.41 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1862  hypothetical protein  24.68 
 
 		 270 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343484  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0746  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.81 
 
 		 251 aa  50.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.51 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.205211 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4209  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  30.25 
 
 		 266 aa  49.3  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2179  hypothetical protein  25.55 
 
 		 270 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.703673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2256  hypothetical protein  25.55 
 
 		 270 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  25.98 
 
 		 270 aa  48.9  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1759  hypothetical protein  25.11 
 
 		 270 aa  49.3  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.197699  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0271  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.69 
 
 		 251 aa  49.3  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.69 
 
 		 251 aa  49.3  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3945  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.69 
 
 		 251 aa  49.3  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0069  demethylmenaquinone methyltransferase  29.6 
 
 		 258 aa  48.9  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2291  methyltransferase type 11  26.55 
 
 		 332 aa  48.5  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.293714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2388  hypothetical protein  25.11 
 
 		 270 aa  48.5  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.307249  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2430  hypothetical protein  24.26 
 
 		 270 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00670242  normal  0.312545 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4146  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.51 
 
 		 251 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5274  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.51 
 
 		 251 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.123369  normal  0.211011 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4057  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.51 
 
 		 251 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4354  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.51 
 
 		 251 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.556022  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4278  Methyltransferase type 11  25.9 
 
 		 186 aa  48.1  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.867588  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4175  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.51 
 
 		 251 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4216  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.51 
 
 		 251 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227535 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4305  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.51 
 
 		 251 aa  48.1  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3707  Methyltransferase type 11  27.16 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52514  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0323  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  28.69 
 
 		 251 aa  47.4  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  28.93 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.28 
 
 		 280 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2515  methyltransferase type 11  25.61 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 281 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0740  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.27 
 
 		 253 aa  46.2  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.69 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2583  hypothetical protein  24.23 
 
 		 270 aa  45.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03675  hypothetical protein  28.69 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4357  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.51 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.51 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.962772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4297  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.51 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2525  hypothetical protein  24.19 
 
 		 276 aa  45.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.637158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4250  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.51 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.51 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4328  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 188 aa  45.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4199  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  27.7 
 
 		 251 aa  45.4  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3960  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.69 
 
 		 251 aa  45.4  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.27 
 
 		 260 aa  45.4  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2996  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.87 
 
 		 254 aa  45.1  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66900  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.23 
 
 		 256 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5802  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.23 
 
 		 256 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5061  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.38 
 
 		 256 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.28 
 
 		 277 aa  45.1  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0829  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.57 
 
 		 253 aa  45.1  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.746498  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2818  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.46 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3373  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.95 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>