48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2256 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2256  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  559  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2388  hypothetical protein  98.15 
 
 		 270 aa  553  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.307249  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2179  hypothetical protein  97.78 
 
 		 270 aa  548  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.703673  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2583  hypothetical protein  90.37 
 
 		 270 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1896  hypothetical protein  85.87 
 
 		 270 aa  495  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275756  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1862  hypothetical protein  85.87 
 
 		 270 aa  495  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343484  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1889  hypothetical protein  85.5 
 
 		 270 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.202516  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2430  hypothetical protein  85.13 
 
 		 270 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00670242  normal  0.312545 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1759  hypothetical protein  82.96 
 
 		 270 aa  486  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.197699  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1623  hypothetical protein  62.86 
 
 		 289 aa  351  7e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2108  hypothetical protein  59.34 
 
 		 276 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0643045  normal  0.737149 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1731  hypothetical protein  64.49 
 
 		 287 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2450  hypothetical protein  57.97 
 
 		 276 aa  334  7.999999999999999e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2525  hypothetical protein  59.34 
 
 		 276 aa  328  4e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.637158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2190  hypothetical protein  60.7 
 
 		 282 aa  322  5e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  hitchhiker  0.00103879 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1936  hypothetical protein  55.56 
 
 		 276 aa  310  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03273  hypothetical protein  50.81 
 
 		 284 aa  248  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3890  putative methyltransferase  49.18 
 
 		 285 aa  236  4e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3092  hypothetical protein  45.35 
 
 		 278 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2682  hypothetical protein  46.43 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4483  methyltransferase type 12  46.48 
 
 		 290 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1436  hypothetical protein  46.43 
 
 		 294 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.710593  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0554  hypothetical protein  47.39 
 
 		 282 aa  222  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5320  methyltransferase-like protein  45.53 
 
 		 332 aa  222  6e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2291  methyltransferase type 11  48.77 
 
 		 332 aa  216  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.293714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03940  predicted O-methyltransferase  41.43 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0267  hypothetical protein  45.05 
 
 		 268 aa  209  5e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000450935  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0629  methyltransferase-like protein  45.93 
 
 		 267 aa  208  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5854  hypothetical protein  43.39 
 
 		 293 aa  202  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1216  hypothetical protein  44.53 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.39056 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2502  O-methyltransferase  43.92 
 
 		 310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1215  hypothetical protein  43.2 
 
 		 280 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.63809 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3094  hypothetical protein  33.06 
 
 		 284 aa  115  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0535  hypothetical protein  32.16 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4278  hypothetical protein  30.25 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327924  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  30.66 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4274  hypothetical protein  25.95 
 
 		 262 aa  72  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3051  hypothetical protein  26.64 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0032  hypothetical protein  24.77 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  24.77 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  26.51 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4519  methyltransferase-like protein  27.08 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3316  hypothetical protein  26.38 
 
 		 262 aa  52.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0177  hypothetical protein  25.56 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.683668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0598  hypothetical protein  26.11 
 
 		 247 aa  50.8  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.17906  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0687  hypothetical protein  25.82 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0246  methyltransferase type 11  25.55 
 
 		 201 aa  49.3  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  25 
 
 		 184 aa  42.7  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>