50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03273 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03273  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  585  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3890  putative methyltransferase  65.89 
 
 
285 aa  336  1.9999999999999998e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3092  hypothetical protein  50.18 
 
 
278 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2450  hypothetical protein  49.48 
 
 
276 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1862  hypothetical protein  52.42 
 
 
270 aa  255  5e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343484  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1896  hypothetical protein  52.02 
 
 
270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275756  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2430  hypothetical protein  51.61 
 
 
270 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00670242  normal  0.312545 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1731  hypothetical protein  49.12 
 
 
287 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2190  hypothetical protein  53.91 
 
 
282 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  hitchhiker  0.00103879 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1936  hypothetical protein  54.92 
 
 
276 aa  252  6e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1759  hypothetical protein  49.61 
 
 
270 aa  251  7e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.197699  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1889  hypothetical protein  51.61 
 
 
270 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.202516  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2583  hypothetical protein  51.61 
 
 
270 aa  247  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2388  hypothetical protein  51.21 
 
 
270 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.307249  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2256  hypothetical protein  50.81 
 
 
270 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2525  hypothetical protein  51.84 
 
 
276 aa  246  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.637158  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2108  hypothetical protein  51.64 
 
 
276 aa  246  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0643045  normal  0.737149 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1623  hypothetical protein  52.19 
 
 
289 aa  246  3e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2179  hypothetical protein  50 
 
 
270 aa  244  8e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.703673  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2682  hypothetical protein  52.23 
 
 
298 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1436  hypothetical protein  51.63 
 
 
294 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.710593  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4483  methyltransferase type 12  45.2 
 
 
290 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0629  methyltransferase-like protein  50.41 
 
 
267 aa  226  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2291  methyltransferase type 11  51.69 
 
 
332 aa  224  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.293714  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0554  hypothetical protein  44.64 
 
 
282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2502  O-methyltransferase  42.26 
 
 
310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5320  methyltransferase-like protein  47.41 
 
 
332 aa  215  5.9999999999999996e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232499  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1216  hypothetical protein  47.73 
 
 
288 aa  214  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.39056 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5854  hypothetical protein  48.94 
 
 
293 aa  212  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1215  hypothetical protein  49.17 
 
 
280 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.63809 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03940  predicted O-methyltransferase  45.02 
 
 
284 aa  208  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0267  hypothetical protein  48.09 
 
 
268 aa  205  7e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000450935  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3094  hypothetical protein  41.53 
 
 
284 aa  151  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0535  hypothetical protein  35.31 
 
 
254 aa  122  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4278  hypothetical protein  31.56 
 
 
254 aa  102  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327924  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3051  hypothetical protein  30.81 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195507  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0032  hypothetical protein  30.15 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  28.64 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  31.16 
 
 
281 aa  69.3  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4519  methyltransferase-like protein  30.41 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148177  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  27.27 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3316  hypothetical protein  28.52 
 
 
262 aa  57.4  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0598  hypothetical protein  27.35 
 
 
247 aa  56.2  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.17906  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0177  hypothetical protein  24.64 
 
 
260 aa  55.8  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.683668  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0246  methyltransferase type 11  23.71 
 
 
201 aa  52.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0687  hypothetical protein  27.64 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4274  hypothetical protein  25.21 
 
 
262 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  26.01 
 
 
252 aa  45.8  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  21.08 
 
 
397 aa  43.5  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  21.6 
 
 
265 aa  42.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>