255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3456 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  512  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0246  methyltransferase type 11  60.1 
 
 		 201 aa  250  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  52.1 
 
 		 241 aa  249  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  41.52 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0687  hypothetical protein  37.9 
 
 		 249 aa  158  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0032  hypothetical protein  39.32 
 
 		 250 aa  148  9e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0177  hypothetical protein  39.35 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.683668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0598  hypothetical protein  39.55 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.17906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3316  hypothetical protein  37.99 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4274  hypothetical protein  35.92 
 
 		 262 aa  135  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3051  hypothetical protein  36.36 
 
 		 267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4519  methyltransferase-like protein  30.53 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3363  hypothetical protein  35.24 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0629  methyltransferase-like protein  28.46 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0535  hypothetical protein  29.23 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4278  hypothetical protein  28.35 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327924  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2450  hypothetical protein  25.27 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0554  hypothetical protein  27.46 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3092  hypothetical protein  28.04 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2108  hypothetical protein  26.92 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0643045  normal  0.737149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5320  methyltransferase-like protein  28.86 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1731  hypothetical protein  27.82 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2682  hypothetical protein  26.32 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1436  hypothetical protein  25.51 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.710593  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1216  hypothetical protein  28.46 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.39056 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2291  methyltransferase type 11  27.8 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.293714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1759  hypothetical protein  26.06 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.197699  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2430  hypothetical protein  24.31 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00670242  normal  0.312545 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1889  hypothetical protein  24.65 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.202516  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2502  O-methyltransferase  27.69 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3094  hypothetical protein  32.32 
 
 		 284 aa  68.6  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1623  hypothetical protein  25.76 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1896  hypothetical protein  23.96 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275756  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1936  hypothetical protein  26.33 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1862  hypothetical protein  24.31 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343484  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3178  methyltransferase type 11  31.87 
 
 		 239 aa  67  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.184817 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2190  hypothetical protein  26.05 
 
 		 282 aa  67  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  hitchhiker  0.00103879 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5854  hypothetical protein  25.73 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  26.13 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03273  hypothetical protein  25.96 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2583  hypothetical protein  24.56 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03940  predicted O-methyltransferase  23.41 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2256  hypothetical protein  25.71 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0267  hypothetical protein  25.51 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000450935  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1215  hypothetical protein  27.78 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.63809 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0635  Methyltransferase type 11  28.9 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2388  hypothetical protein  25.36 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.307249  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2525  hypothetical protein  24.21 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.637158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2313  generic methyltransferase  30.29 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0714275  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4483  methyltransferase type 12  27.39 
 
 		 290 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3622  methyltransferase type 11  30.38 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.932817  normal  0.0502026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  27.49 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2179  hypothetical protein  25 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.703673  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4146  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.65 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4354  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.65 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.556022  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4305  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.65 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4057  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.65 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4216  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.65 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227535 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4175  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.65 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5274  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.65 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.123369  normal  0.211011 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.65 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  23.71 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03675  hypothetical protein  34.65 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4209  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  35.71 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3890  putative methyltransferase  25.97 
 
 		 285 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0656  methyltransferase type 11  27.17 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  0.351614 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2996  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.69 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0597  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  34.06 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.369183  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3960  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.65 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  31.01 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1099  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.09 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.729785  normal  0.0384798 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0542  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  31.5 
 
 		 261 aa  53.1  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3469  Methyltransferase type 11  24.54 
 
 		 243 aa  52.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.508961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0667  Methyltransferase type 11  27.17 
 
 		 243 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0338996 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.51 
 
 		 265 aa  52.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.07 
 
 		 201 aa  52.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3415  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.28 
 
 		 260 aa  52.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.79 
 
 		 237 aa  52  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3202  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  33.56 
 
 		 251 aa  52  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  25.66 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3792  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.61 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0323  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  34.43 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4188  Methyltransferase type 11  25.6 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.01 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.97 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.97 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.97 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.86 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.205211 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  27.17 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0785  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 		 373 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.97 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  34.65 
 
 		 233 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.97 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2150  methyltransferase type 11  24.44 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.301161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3373  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.6 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.97 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4297  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.28 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.28 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.962772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.16 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.126123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>