156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2890 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2890  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 257 aa  515  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 237 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9121  putative transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0011  transcriptional regulator, GntR family  34.14 
 
 		 240 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  29.69 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  29.72 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  29.54 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  27.89 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2096  putative transcriptional regulator, GntR family  28.28 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  27.12 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0154  putative transcriptional regulator, GntR family  28.74 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3598  transcriptional regulator, GntR family  28.06 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9120  putative transcriptional regulator, GntR family  36.92 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  26.98 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2167  putative transcriptional regulator, GntR family  30.56 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2323  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0617255  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1280  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  26.42 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  27.42 
 
 		 241 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0700  putative transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2891  putative transcriptional regulator, GntR family  30.2 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.423271  normal  0.177095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0718  putative transcriptional regulator, GntR family  28.7 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0088  transcriptional regulator, GntR family  26.09 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0856057  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  28.06 
 
 		 259 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1748  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  24.69 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  25.41 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20350  putative transcriptional regulator  24.48 
 
 		 240 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238526  normal  0.704224 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1078  GntR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 245 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358733  hitchhiker  0.00355085 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  27.78 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5417  transcriptional regulator, GntR family  28.3 
 
 		 271 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  27.8 
 
 		 255 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2647  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 115 aa  52  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4518  transcriptional regulator, GntR family  25.81 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8675  putative transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 		 157 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0769  transcriptional regulator, GntR family  25.81 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  26.32 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2169  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.07 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0719  putative transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  24.9 
 
 		 237 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0046  transcriptional regulator, GntR family  25.69 
 
 		 244 aa  48.9  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0917  transcriptional regulator, GntR family  44.74 
 
 		 280 aa  48.9  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0144  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  35.56 
 
 		 180 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0151  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  35.56 
 
 		 180 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5106  histidine utilization repressor  28.63 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0814369  hitchhiker  0.00493265 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1687  GntR family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  36.05 
 
 		 115 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0065  GntR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 128 aa  47  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  26.16 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1572  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 288 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289458 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6358  transcriptional regulator, GntR family  39.73 
 
 		 127 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2558  transcriptional regulator PhnF  25.44 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153571  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4955  putative transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 248 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  23.81 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3791  transcriptional regulator, GntR family  43.55 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1272  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 132 aa  46.6  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  29.75 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  29.75 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  28.38 
 
 		 244 aa  46.2  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  38.24 
 
 		 126 aa  46.2  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  25.4 
 
 		 247 aa  45.8  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2328  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.47 
 
 		 205 aa  45.8  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.452351  hitchhiker  0.00271945 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  40.85 
 
 		 463 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1962  GntR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00453299  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  41.79 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1209  transcriptional regulator, GntR family  39.24 
 
 		 118 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0188078 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  37.93 
 
 		 124 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  24.02 
 
 		 241 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4811  transcriptional regulator, GntR family  25.2 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  23.89 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4439  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  29.19 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.879894 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0474  transcriptional regulator, GntR family  27.5 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1100  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1165  histidine utilization repressor  24.8 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3548  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  28.08 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.701913 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  37.68 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0086  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 126 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8668  putative transcriptional regulator, GntR family  36.9 
 
 		 111 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1226  GntR family transcriptional regulator  45 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.804907 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  25.1 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  29.09 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5539  regulatory protein GntR HTH  36.47 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1307  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  25.24 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00330813  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  26.13 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>