75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0151 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0151  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  100 
 
 		 180 aa  349  1e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0144  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  100 
 
 		 180 aa  349  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9120  putative transcriptional regulator, GntR family  50.28 
 
 		 179 aa  167  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 237 aa  99  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 237 aa  97.1  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2891  putative transcriptional regulator, GntR family  39.24 
 
 		 175 aa  90.5  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.423271  normal  0.177095 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  37.14 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2096  putative transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 248 aa  74.7  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9121  putative transcriptional regulator, GntR family  41.98 
 
 		 244 aa  74.7  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  39.29 
 
 		 242 aa  67.8  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1001  putative transcriptional regulator, GntR family  31.76 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0797  putative GntR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 179 aa  62  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.288105  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5286  transcriptional regulator, GntR family  36.42 
 
 		 243 aa  61.2  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0011  transcriptional regulator, GntR family  32.64 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0719  putative transcriptional regulator, GntR family  26.58 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  33.58 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 246 aa  53.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  34.71 
 
 		 259 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 267 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1280  transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 		 233 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2890  transcriptional regulator, GntR family  35.35 
 
 		 257 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  28.79 
 
 		 269 aa  48.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  28.79 
 
 		 258 aa  48.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  31.45 
 
 		 266 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0154  putative transcriptional regulator, GntR family  34.86 
 
 		 245 aa  48.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 262 aa  47.8  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  36.45 
 
 		 261 aa  47.8  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 252 aa  47.8  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 274 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 274 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  32.12 
 
 		 244 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3598  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 251 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  30.15 
 
 		 241 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 274 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 271 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.73 
 
 		 246 aa  46.2  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  27.11 
 
 		 254 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4360  GntR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 266 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 245 aa  45.1  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1813  histidine utilization repressor  30.82 
 
 		 234 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.167757 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0776  transcriptional regulator, GntR family  22.45 
 
 		 244 aa  44.7  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 278 aa  45.1  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0474  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 246 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 274 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 259 aa  43.9  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3933  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 274 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4434  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 274 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05542  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  27.59 
 
 		 273 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 278 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1234  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.49 
 
 		 272 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.550496  normal  0.0276711 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 278 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 376 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  27.27 
 
 		 274 aa  42.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 266 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 332 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 376 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2167  putative transcriptional regulator, GntR family  32.28 
 
 		 241 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  26.76 
 
 		 244 aa  42.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 266 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 266 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 266 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 266 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 257 aa  42.4  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1002  transcriptional regulator, GntR family  25.42 
 
 		 248 aa  41.6  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5389  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 260 aa  41.2  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2386  histidine utilization repressor  30.2 
 
 		 231 aa  41.2  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 248 aa  41.2  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3308  transcriptional regulator, GntR family  24.58 
 
 		 248 aa  40.8  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>