64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1001 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1001  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 295 aa  580  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0719  putative transcriptional regulator, GntR family  64.64 
 
 		 268 aa  338  8e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0797  putative GntR family transcriptional regulator  74.3 
 
 		 179 aa  277  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.288105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3038  hypothetical protein  58.65 
 
 		 122 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3039  hypothetical protein  52.94 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 253 aa  68.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2323  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0617255  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2169  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.86 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9120  putative transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  29.53 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  31.33 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23790  hypothetical protein  45.45 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00000260042  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  37.78 
 
 		 259 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2096  putative transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0178  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.516335 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0198  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0189  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  31.15 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  30.17 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  33.08 
 
 		 259 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  28.07 
 
 		 243 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0154  putative transcriptional regulator, GntR family  28.97 
 
 		 245 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4527  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  39.13 
 
 		 279 aa  49.3  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2891  putative transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 175 aa  48.9  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.423271  normal  0.177095 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  29.92 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  28.05 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  30.63 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2328  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.06 
 
 		 205 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.452351  hitchhiker  0.00271945 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  36.27 
 
 		 263 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  27.98 
 
 		 244 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9121  putative transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 		 244 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 251 aa  47  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2758  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  24.07 
 
 		 240 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0700  putative transcriptional regulator, GntR family  35.16 
 
 		 238 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3598  transcriptional regulator, GntR family  35.92 
 
 		 251 aa  46.2  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0056  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.59 
 
 		 232 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0718  putative transcriptional regulator, GntR family  34.07 
 
 		 238 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0474  transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0011  transcriptional regulator, GntR family  27.86 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 239 aa  43.5  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2751  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  23.08 
 
 		 239 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 248 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  25.99 
 
 		 247 aa  43.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  25.16 
 
 		 195 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 248 aa  43.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0144  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.48 
 
 		 180 aa  43.5  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0151  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.48 
 
 		 180 aa  43.5  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0063  putative transcriptional regulator, GntR family  34.02 
 
 		 107 aa  43.1  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  25.16 
 
 		 195 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  25.16 
 
 		 195 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  29.77 
 
 		 245 aa  42.4  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>