More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9121 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9121  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
244 aa  491  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  61.74 
 
 
237 aa  275  7e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  61.74 
 
 
237 aa  274  8e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0011  transcriptional regulator, GntR family  39.24 
 
 
240 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2890  transcriptional regulator, GntR family  36.86 
 
 
257 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2096  putative transcriptional regulator, GntR family  34.73 
 
 
248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  32.93 
 
 
263 aa  113  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  32.94 
 
 
261 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  32.93 
 
 
261 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 
257 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  34.69 
 
 
259 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9120  putative transcriptional regulator, GntR family  39.63 
 
 
179 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 
242 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  32.07 
 
 
250 aa  98.6  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2323  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
263 aa  98.2  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0617255  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  33.05 
 
 
255 aa  96.3  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
246 aa  95.9  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
254 aa  95.9  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  29.27 
 
 
253 aa  95.1  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  30.74 
 
 
241 aa  92.4  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 
250 aa  91.7  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2169  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.61 
 
 
271 aa  90.1  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225688  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  27.43 
 
 
241 aa  85.9  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3598  transcriptional regulator, GntR family  31.17 
 
 
251 aa  81.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0154  putative transcriptional regulator, GntR family  30.74 
 
 
245 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0769  transcriptional regulator, GntR family  27.94 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4518  transcriptional regulator, GntR family  27.94 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0088  transcriptional regulator, GntR family  28.05 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0856057  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  30.74 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2891  putative transcriptional regulator, GntR family  36.62 
 
 
175 aa  79  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.423271  normal  0.177095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0474  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  26.47 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2167  putative transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2856  histidine utilization repressor  28.95 
 
 
255 aa  75.1  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5286  transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 
243 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0046  transcriptional regulator, GntR family  28.86 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0144  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  42.31 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0151  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  42.31 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2966  histidine utilization repressor  29.26 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665384  normal  0.740013 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2717  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1044  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
269 aa  68.9  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.523425  normal  0.272848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0917  transcriptional regulator, GntR family  45.07 
 
 
280 aa  68.9  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0700  putative transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 
238 aa  68.6  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  25.33 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  27.92 
 
 
274 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2005  transcriptional regulator, GntR family  27.87 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00857221  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  27.08 
 
 
270 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  29.6 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0718  putative transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  25.33 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  25.22 
 
 
234 aa  67  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4612  histidine utilization repressor  27.31 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980762  hitchhiker  0.00350601 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4360  GntR family transcriptional regulator  25.86 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5243  histidine utilization repressor  27.31 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5616  histidine utilization repressor  27.31 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0255  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  25.53 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0249  GntR family transcriptional regulator  25.53 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0075  histidine utilization repressor  26.87 
 
 
245 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5605  transcriptional regulator, GntR family  29.83 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1606  transcriptional regulator, GntR family  29.53 
 
 
241 aa  65.1  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000225231  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  26.38 
 
 
267 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  26.38 
 
 
266 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  26.38 
 
 
243 aa  64.3  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
284 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3229  histidine utilization repressor  27.07 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.259882 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.75 
 
 
243 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  26.38 
 
 
271 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  25.64 
 
 
256 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 
256 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  26.38 
 
 
274 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 
256 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5445  histidine utilization repressor  26.2 
 
 
245 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0118538  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  25.78 
 
 
262 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 
256 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  28.39 
 
 
242 aa  63.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  25.64 
 
 
256 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  38.55 
 
 
124 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.75 
 
 
243 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  25.75 
 
 
287 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4895  histidine utilization repressor  26.2 
 
 
245 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0717  transcriptional regulator, GntR family  26.48 
 
 
285 aa  62.4  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
278 aa  62.4  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4434  GntR family transcriptional regulator  25.43 
 
 
274 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  25.43 
 
 
274 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3933  GntR family transcriptional regulator  25.43 
 
 
274 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  32.62 
 
 
261 aa  62  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  32.62 
 
 
261 aa  62  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2388  GntR family transcriptional regulator  26.75 
 
 
248 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1448  transcriptional regulator, GntR family  25.94 
 
 
241 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
247 aa  61.6  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
245 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0086  GntR family transcriptional regulator  45.59 
 
 
126 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1280  transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 
233 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1556  transcriptional regulator, GntR family  25.53 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.868549  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3079  transcriptional regulator, GntR family  25.53 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0964  GntR family transcriptional regulator  25.53 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  24.79 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0794477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>