More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2323 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2323  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
263 aa  527  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0617255  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2169  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  92.45 
 
 
271 aa  488  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225688  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 
248 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 
243 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 
243 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 
243 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 
243 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  30 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  27.71 
 
 
243 aa  97.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  27.15 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  32.22 
 
 
263 aa  94  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  30.47 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 
284 aa  92  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
237 aa  91.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 
254 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 
251 aa  91.3  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  28.69 
 
 
257 aa  89.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0154  putative transcriptional regulator, GntR family  27.82 
 
 
245 aa  89  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0474  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 
246 aa  89  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
266 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
266 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
266 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
266 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
266 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 
332 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 
376 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
274 aa  86.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0700  putative transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 
238 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9121  putative transcriptional regulator, GntR family  30.47 
 
 
244 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0718  putative transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 
238 aa  85.9  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
274 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  27.85 
 
 
376 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  26.46 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  26.46 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  28.87 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0046  transcriptional regulator, GntR family  25.74 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  26.75 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
271 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  27.42 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  30.49 
 
 
248 aa  81.6  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
274 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1802  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0871111  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4434  GntR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3933  GntR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  26.03 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  27.9 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  26.03 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  26.01 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2707  GntR family transcriptional regulator  24.69 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0952006 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1749  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.37809  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  28.28 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4360  GntR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2005  transcriptional regulator, GntR family  31.56 
 
 
249 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00857221  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5243  histidine utilization repressor  27.59 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5616  histidine utilization repressor  27.59 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 
246 aa  78.6  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.68 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  26.27 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  28.34 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0075  histidine utilization repressor  27.59 
 
 
245 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5445  histidine utilization repressor  27.59 
 
 
245 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0118538  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  25.89 
 
 
256 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
262 aa  77  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  29.22 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1064  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.296534  normal  0.0288799 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4612  histidine utilization repressor  27.16 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980762  hitchhiker  0.00350601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
243 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
308 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4438  transcriptional regulator, GntR family  27.66 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  26.5 
 
 
247 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  27.9 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  26.81 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  26.17 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4895  histidine utilization repressor  27.16 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3229  histidine utilization repressor  27.23 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.259882 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  27.37 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1100  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  27.31 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2171  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  27.37 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3031  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  26.36 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.921184 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5286  transcriptional regulator, GntR family  29.18 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  25.44 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  27.37 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  26.41 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  28.63 
 
 
240 aa  72  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  25.78 
 
 
242 aa  72  0.000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3606  histidine utilization repressor  27.88 
 
 
231 aa  72  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2386  histidine utilization repressor  31.29 
 
 
231 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3799  histidine utilization repressor  31.29 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0816062 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3722  histidine utilization repressor  31.29 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0942262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>