More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4438 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4438  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 246 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0474  transcriptional regulator, GntR family  38.95 
 
 		 246 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5286  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  26.24 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2323  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0617255  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  26.44 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  29.46 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  29.49 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1280  transcriptional regulator, GntR family  28.75 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4518  transcriptional regulator, GntR family  26.1 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  25.42 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  24.37 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0769  transcriptional regulator, GntR family  26.1 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  27.19 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4392  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  26.67 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2169  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  26.84 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  23.48 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  36.29 
 
 		 315 aa  65.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  24.79 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3530  GntR family transcriptional regulator  21.82 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2016  transcriptional regulator, GntR family  21.49 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.47195  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3762  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  23.68 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 240 aa  62  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0154  putative transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0342  transcriptional regulator, GntR family  25.68 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  43.08 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  21.36 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  24.56 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  24.89 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  22.69 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0046  transcriptional regulator, GntR family  27.92 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  26.96 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  24.79 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.533333 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5461  GntR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  24.58 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2768  GntR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1446  transcriptional regulator, GntR family  28.18 
 
 		 290 aa  58.5  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2024  transcriptional regulator, GntR family  28.18 
 
 		 290 aa  58.5  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.205752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0700  putative transcriptional regulator, GntR family  29.55 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2171  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3959  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0354607  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_003296  RS05542  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  26.78 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0430  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 		 130 aa  57.4  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4668  transcriptional regulator, GntR family  25.71 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3424  GntR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014089  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  26.56 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  23.53 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  26.56 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  41.18 
 
 		 121 aa  57  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 284 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0335  transcriptional regulator, GntR family  25.78 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2197  GntR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  24.47 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  25.81 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2152  GntR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 465 aa  56.6  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  20.72 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0718  putative transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  23.95 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  25.32 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  38.37 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2648  histidine utilization repressor transcription regulator protein  26.92 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0949  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1390  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0431  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>