More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2016 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2016  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 242 aa  497  1e-140  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.47195  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1334  transcriptional regulator, GntR family  47.46 
 
 		 239 aa  214  8e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  decreased coverage  0.000248139 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0603  transcriptional regulator, GntR family  37.87 
 
 		 239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.971454  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0698  trehalose operon transcriptional repressor  40.17 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0543  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0685  trehalose operon repressor  40.17 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.327487 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0759  trehalose operon repressor  39.74 
 
 		 236 aa  168  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4671  trehalose operon repressor  40.6 
 
 		 236 aa  168  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.38863e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0597  trehalose operon transcriptional repressor  40.17 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.464881  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0541  trehalose operon transcriptional repressor  40.17 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0541  trehalose operon transcriptional repressor  40.17 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0666  trehalose operon repressor  40.17 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0630  trehalose operon transcriptional repressor  40.17 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  39.24 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  39.24 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1622  transcriptional regulator, GntR family  38.03 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2552  transcriptional regulator, GntR family  36.13 
 
 		 237 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1339  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 240 aa  138  7.999999999999999e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.344054  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0510  GntR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0480  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 233 aa  126  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00570822  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0076  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.15859  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3530  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  29.2 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 238 aa  108  8.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3424  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014089  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 248 aa  105  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3424  transcriptional regulator, GntR family  29.18 
 
 		 245 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3183  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 245 aa  105  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.529781  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3204  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3111  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3458  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  29.54 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3436  transcriptional regulator, GntR family  28.76 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1833  transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0220411  normal  0.173691 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3412  transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 		 245 aa  102  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  29.69 
 
 		 237 aa  101  9e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0497  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0510  trehalose operon repressor  30.17 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  25.64 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0534  transcriptional regulator  33.6 
 
 		 300 aa  96.7  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.207932  hitchhiker  0.0000000000234574 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 242 aa  94.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  27.66 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0188  transcriptional regulator  28.24 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0560306 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  27.8 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 248 aa  89  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1740  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40989  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0191  transcriptional regulator  28.19 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.168496 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1621  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00823964  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0559  transcriptional regulator  27.83 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000128597  hitchhiker  0.00000147754 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1632  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 232 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.367647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5116  transcriptional regulator, GntR family  26.78 
 
 		 238 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3593  transcriptional regulator, GntR family  28.7 
 
 		 239 aa  85.1  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  26.14 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0020  transcriptional regulator, GntR family  26.61 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  26.14 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0019  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  26.14 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1687  GntR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4049  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.855147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  26.14 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4235  transcriptional regulator, GntR family  26.61 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  26.14 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3202  transcriptional regulator, GntR family  30.74 
 
 		 237 aa  85.1  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  25.47 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0255  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  26.07 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0249  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  26.14 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4192  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  25.89 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  27.39 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3895  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  25.38 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  24.37 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  25.11 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  24.37 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  24.37 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  24.37 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  24.37 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  24.37 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2751  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  26.89 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  24.37 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  25.38 
 
 		 195 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  24.37 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  27.59 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4392  GntR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0420  GntR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.330179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0456  GntR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1435  transcriptional regulator  25.73 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.851115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2301  GntR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>