More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5286 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5286  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 243 aa  481  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  77.78 
 
 		 246 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0700  putative transcriptional regulator, GntR family  51.05 
 
 		 238 aa  231  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0718  putative transcriptional regulator, GntR family  50.21 
 
 		 238 aa  228  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0154  putative transcriptional regulator, GntR family  48.35 
 
 		 245 aa  222  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0046  transcriptional regulator, GntR family  47.5 
 
 		 244 aa  211  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  46.47 
 
 		 242 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0337  GntR family transcriptional regulator  68.92 
 
 		 105 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.186811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0474  transcriptional regulator, GntR family  33.47 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 259 aa  99  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  30.6 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4438  transcriptional regulator, GntR family  31.74 
 
 		 246 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  30.12 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2323  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0617255  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  31.45 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1606  transcriptional regulator, GntR family  26.72 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000225231  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2169  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.18 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225688  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  26.45 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  37.01 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  30.13 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  27.49 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5461  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  35.42 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  35.42 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2167  putative transcriptional regulator, GntR family  26.92 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  32.17 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9121  putative transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2197  GntR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3370  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  24.59 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  27.35 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  27 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1100  GntR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2005  transcriptional regulator, GntR family  30.8 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00857221  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3799  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392461  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  25.94 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  26.44 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4360  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0011  transcriptional regulator, GntR family  25.55 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1531  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  29.41 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.250236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2760  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0304853  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3606  histidine utilization repressor  28.75 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0157  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  36.84 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  34.27 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5462  histidine utilization repressor  28.75 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1833  transcriptional regulator, GntR family  30.67 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0220411  normal  0.173691 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2408  histidine utilization repressor  25.69 
 
 		 266 aa  65.1  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.067403  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 255 aa  65.1  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5005  histidine utilization repressor  28.75 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1044  GntR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.523425  normal  0.272848 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1165  histidine utilization repressor  25.7 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  28.19 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0886  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  25.85 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1888  GntR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2386  histidine utilization repressor  28.81 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4103  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4641  histidine utilization repressor  28.33 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3799  histidine utilization repressor  28.33 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0816062 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3722  histidine utilization repressor  28.33 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  24.27 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  29.75 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2096  putative transcriptional regulator, GntR family  27.66 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1317  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2016  transcriptional regulator, GntR family  25.31 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.47195  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2946  histidine utilization repressor  27.42 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4179  regulatory protein GntR HTH  28.7 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0510  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3183  GntR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.529781  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  27.14 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>