More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1280 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1280  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 233 aa  474  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  45.82 
 
 		 259 aa  191  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  33.76 
 
 		 250 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 253 aa  111  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  33.6 
 
 		 259 aa  108  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 250 aa  105  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  32.92 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  29.88 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3598  transcriptional regulator, GntR family  34.01 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  32.22 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0717  transcriptional regulator, GntR family  31.2 
 
 		 285 aa  92.8  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 252 aa  92.4  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2005  transcriptional regulator, GntR family  30.04 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00857221  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4438  transcriptional regulator, GntR family  27.92 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  28.19 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  28.26 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  28.32 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  26.94 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2096  putative transcriptional regulator, GntR family  30.17 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  29.96 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  28.18 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2167  putative transcriptional regulator, GntR family  28.99 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3644  histidine utilization repressor  26.84 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2717  GntR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  28.16 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4840  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  28.57 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.180839 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1823  histidine utilization repressor  29.39 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325999  normal  0.489419 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2856  histidine utilization repressor  26.61 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0157  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  25.75 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2323  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0617255  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2966  histidine utilization repressor  26.2 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665384  normal  0.740013 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0995  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352191  normal  0.964514 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  26.75 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  24.68 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4125  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  28.57 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0046  transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2169  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  25.62 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0013  GntR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000501062  n/a   
 
 
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  24.44 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0011  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1044  GntR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.523425  normal  0.272848 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2925  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  28.12 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.608421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9121  putative transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4612  histidine utilization repressor  23.61 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980762  hitchhiker  0.00350601 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2171  GntR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5243  histidine utilization repressor  23.61 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5616  histidine utilization repressor  23.61 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  27.24 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7034  putative transcriptional regulator, GntR family  27.89 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0075  histidine utilization repressor  23.93 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2890  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3959  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0354607  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2738  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  29.83 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4439  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  27.39 
 
 		 245 aa  62  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.879894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0700  putative transcriptional regulator, GntR family  28.42 
 
 		 238 aa  62  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  23.42 
 
 		 262 aa  62  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 246 aa  62  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0056  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.7 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210738 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  20.89 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  20.89 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  20.89 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  20.89 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1484  transcriptional regulator, GntR family  23.21 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  20.89 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3772  GntR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  27.48 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1316  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3308  transcriptional regulator, GntR family  26.09 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0718  putative transcriptional regulator, GntR family  28.27 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0081  histidine utilization repressor  26.86 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02029  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.27 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1556  transcriptional regulator, GntR family  26.27 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.868549  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3079  transcriptional regulator, GntR family  26.27 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2388  GntR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  22.47 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4157  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.497952  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01993  hypothetical protein  26.27 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  23.91 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1138  transcriptional regulator, GntR family  26.27 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.252402  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1546  GntR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.599104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0964  GntR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2237  GntR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2581  GntR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9120  putative transcriptional regulator, GntR family  36.13 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5106  histidine utilization repressor  27 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0814369  hitchhiker  0.00493265 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5870  GntR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20350  putative transcriptional regulator  29 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238526  normal  0.704224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>