60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9120 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9120  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 179 aa  360  6e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0151  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  50.28 
 
 		 180 aa  152  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0144  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  50.28 
 
 		 180 aa  152  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  43.29 
 
 		 237 aa  110  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 237 aa  107  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2891  putative transcriptional regulator, GntR family  39.64 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.423271  normal  0.177095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9121  putative transcriptional regulator, GntR family  39.63 
 
 		 244 aa  92.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2096  putative transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 252 aa  78.2  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 259 aa  74.7  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 259 aa  72  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  32.93 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  34.31 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 		 255 aa  67.8  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0011  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 240 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1001  putative transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  28.22 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0797  putative GntR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 179 aa  62  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.288105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0719  putative transcriptional regulator, GntR family  26.58 
 
 		 268 aa  61.6  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  30.52 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2890  transcriptional regulator, GntR family  39 
 
 		 257 aa  58.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  29.68 
 
 		 244 aa  57.8  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 246 aa  57  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  28.92 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1280  transcriptional regulator, GntR family  36.13 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1962  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 242 aa  51.6  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00453299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2896  putative transcriptional regulator, GntR family  31.36 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407099  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 		 278 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  34.07 
 
 		 243 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5286  transcriptional regulator, GntR family  33.06 
 
 		 243 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 254 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  26.45 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  26.72 
 
 		 263 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1687  GntR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 243 aa  46.6  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  33.06 
 
 		 259 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3598  transcriptional regulator, GntR family  31.97 
 
 		 251 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  29.03 
 
 		 257 aa  45.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  27.88 
 
 		 263 aa  45.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 256 aa  45.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0178  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 260 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.516335 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0198  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 260 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0189  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 260 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1234  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.03 
 
 		 272 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.550496  normal  0.0276711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5417  transcriptional regulator, GntR family  27.1 
 
 		 271 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0776  transcriptional regulator, GntR family  21.28 
 
 		 244 aa  42.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  27.92 
 
 		 242 aa  42.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5574  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.85 
 
 		 255 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1317  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 271 aa  42  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.86 
 
 		 243 aa  42  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3517  GntR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 238 aa  41.6  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4668  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 250 aa  41.6  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  25.78 
 
 		 269 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 256 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  25.78 
 
 		 258 aa  41.2  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0088  transcriptional regulator, GntR family  27.12 
 
 		 270 aa  40.8  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0856057  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2323  GntR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 263 aa  41.2  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0617255  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 251 aa  40.8  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 257 aa  40.8  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>