More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0776 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0776  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 244 aa  501  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  28.11 
 
 		 235 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  29.78 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.67 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  29.78 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  29.78 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  29.78 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  29.78 
 
 		 240 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  29.78 
 
 		 240 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3202  transcriptional regulator, GntR family  29.65 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1962  GntR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00453299  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  25.56 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3593  transcriptional regulator, GntR family  24.56 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  28.78 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  27.62 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1778  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00599457  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  27.11 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  26.05 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  26.96 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3873  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  28.17 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  26.03 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0188  transcriptional regulator  27.43 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0560306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  25.69 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1687  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  25.23 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  24.34 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  27.04 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  24.34 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  27.04 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3424  GntR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014089  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0559  transcriptional regulator  26.7 
 
 		 242 aa  72  0.000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000128597  hitchhiker  0.00000147754 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 243 aa  72  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2966  histidine utilization repressor  23.81 
 
 		 260 aa  71.6  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665384  normal  0.740013 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3424  transcriptional regulator, GntR family  25.97 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  22.47 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1833  transcriptional regulator, GntR family  25.97 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0220411  normal  0.173691 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0178  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.516335 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3183  GntR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.529781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0198  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  24.55 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0189  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1309  GntR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  22.91 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1211  GntR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  23.89 
 
 		 274 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1064  transcriptional regulator, GntR family  25.79 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.296534  normal  0.0288799 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  22.62 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3412  transcriptional regulator, GntR family  27.12 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3111  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  23.89 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  25.23 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3436  transcriptional regulator, GntR family  24.89 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  27.16 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  32.41 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3204  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264865  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 332 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3458  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  26.07 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0191  transcriptional regulator  27.44 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.168496 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 376 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  26.39 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1883  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0020  transcriptional regulator, GntR family  24.75 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4049  GntR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.855147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1740  GntR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40989  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0722  GntR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5116  transcriptional regulator, GntR family  24.75 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0019  GntR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4235  transcriptional regulator, GntR family  24.75 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6218  transcriptional regulator, GntR family  22.77 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  25.7 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3031  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  22.73 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.921184 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0349  transcriptional regulatory protein  25.45 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  26.85 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3803  transcriptional regulator, GntR family  28.1 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.596979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>