More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1284 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 255 aa  512  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  54.36 
 
 		 250 aa  236  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  52.3 
 
 		 250 aa  235  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  51.01 
 
 		 259 aa  226  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  39.84 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  41.09 
 
 		 261 aa  175  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  36.33 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 252 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  33.74 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  34.44 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  34.96 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2096  putative transcriptional regulator, GntR family  34.68 
 
 		 248 aa  118  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2005  transcriptional regulator, GntR family  33.47 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00857221  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1280  transcriptional regulator, GntR family  32.22 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 237 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3598  transcriptional regulator, GntR family  33.07 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2167  putative transcriptional regulator, GntR family  33.6 
 
 		 241 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9121  putative transcriptional regulator, GntR family  32.63 
 
 		 244 aa  92.4  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  30.83 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2323  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0617255  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  29.57 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  29.79 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  32.62 
 
 		 278 aa  89.4  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5605  transcriptional regulator, GntR family  31.69 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4811  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 247 aa  85.9  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0474  transcriptional regulator, GntR family  33.78 
 
 		 246 aa  85.9  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2169  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.23 
 
 		 271 aa  85.1  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0717  transcriptional regulator, GntR family  29.22 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2896  putative transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407099  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0144  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  39.32 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0151  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  39.32 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  29.6 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0011  transcriptional regulator, GntR family  29.83 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9120  putative transcriptional regulator, GntR family  32.47 
 
 		 179 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0513  transcriptional regulator, GntR family  28.38 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204845 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  25.94 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2891  putative transcriptional regulator, GntR family  35.03 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.423271  normal  0.177095 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0033  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1078  GntR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358733  hitchhiker  0.00355085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2652  regulatory protein GntR, HTH  30.84 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  26.84 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4434  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3933  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7288  putative transcriptional regulator, GntR family  32.76 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.767574 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  27.46 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.02 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  30.67 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1002  transcriptional regulator, GntR family  25.2 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0088  transcriptional regulator, GntR family  25.62 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0856057  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.8 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0249  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  26.52 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10808  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000218529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0154  putative transcriptional regulator, GntR family  29.08 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0255  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  25 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  27.42 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2171  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  25.61 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0812  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  29.58 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0046  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3308  transcriptional regulator, GntR family  24.8 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4360  GntR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  26.07 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.53 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4080  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.92 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.515439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2239  GntR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>