81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0797 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0797  putative GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 179 aa  352  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.288105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1001  putative transcriptional regulator, GntR family  74.3 
 
 		 295 aa  277  8e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0719  putative transcriptional regulator, GntR family  65.92 
 
 		 268 aa  245  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3038  hypothetical protein  66.35 
 
 		 122 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 259 aa  74.3  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2323  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 263 aa  64.7  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0617255  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2169  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  35.43 
 
 		 271 aa  64.3  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2096  putative transcriptional regulator, GntR family  32.11 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9120  putative transcriptional regulator, GntR family  29.45 
 
 		 179 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  34.53 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  32.47 
 
 		 261 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0178  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.516335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0189  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0198  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  26.85 
 
 		 261 aa  54.7  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 249 aa  54.3  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  29.45 
 
 		 242 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0700  putative transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 238 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0154  putative transcriptional regulator, GntR family  32.48 
 
 		 245 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 251 aa  52.4  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  31.97 
 
 		 255 aa  51.2  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 225 aa  51.2  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0718  putative transcriptional regulator, GntR family  32.59 
 
 		 238 aa  51.2  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 255 aa  50.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 		 243 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0063  putative transcriptional regulator, GntR family  36.08 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 		 244 aa  48.1  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 243 aa  48.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  33.83 
 
 		 259 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0011  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 240 aa  47.8  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 248 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2891  putative transcriptional regulator, GntR family  31.01 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.423271  normal  0.177095 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 243 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3959  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0354607  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  31.01 
 
 		 261 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 243 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1749  transcriptional regulator, GntR family  30.83 
 
 		 249 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.37809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  26.28 
 
 		 195 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  31.01 
 
 		 261 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 243 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 243 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  26.28 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  26.28 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  27.16 
 
 		 278 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  27.16 
 
 		 278 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4184  transcriptional regulator, GntR family  25.64 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000338347  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2328  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.33 
 
 		 205 aa  45.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.452351  hitchhiker  0.00271945 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 254 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 250 aa  44.7  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0776  transcriptional regulator, GntR family  24.05 
 
 		 244 aa  43.9  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5574  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.53 
 
 		 255 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0056  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.71 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3598  transcriptional regulator, GntR family  31.72 
 
 		 251 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05542  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  24.84 
 
 		 273 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 248 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 248 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2171  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 258 aa  42  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0144  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.82 
 
 		 180 aa  42.4  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 250 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 248 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  26.34 
 
 		 242 aa  42.4  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0151  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.82 
 
 		 180 aa  42.4  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5286  transcriptional regulator, GntR family  31.29 
 
 		 243 aa  42  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 274 aa  42  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0151  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 237 aa  42  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 248 aa  41.6  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2197  GntR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 256 aa  41.6  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 248 aa  41.6  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0046  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 244 aa  41.6  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 258 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 246 aa  41.2  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  26.62 
 
 		 256 aa  41.2  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 258 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  26.77 
 
 		 274 aa  41.2  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0724  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 235 aa  41.2  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 232 aa  41.2  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  27.56 
 
 		 258 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  27.56 
 
 		 269 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>