23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2328 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2328  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  100 
 
 		 205 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.452351  hitchhiker  0.00271945 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2450  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  74.26 
 
 		 204 aa  302  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.501788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0717  transcriptional regulator, GntR family  51.81 
 
 		 285 aa  186  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2005  transcriptional regulator, GntR family  35.77 
 
 		 249 aa  58.2  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00857221  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  31.01 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2323  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 263 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0617255  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  30.89 
 
 		 261 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  32.39 
 
 		 255 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 259 aa  50.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  33.61 
 
 		 254 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1001  putative transcriptional regulator, GntR family  32.06 
 
 		 295 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 254 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 263 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2169  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.25 
 
 		 271 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225688  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 250 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0797  putative GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 179 aa  45.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.288105  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 257 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  34.04 
 
 		 261 aa  45.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  30.89 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3598  transcriptional regulator, GntR family  37.12 
 
 		 251 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  38.24 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  31.5 
 
 		 259 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>