More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0700 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0700  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 238 aa  474  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0718  putative transcriptional regulator, GntR family  98.32 
 
 		 238 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0046  transcriptional regulator, GntR family  56.25 
 
 		 244 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  52.74 
 
 		 246 aa  236  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0154  putative transcriptional regulator, GntR family  51.9 
 
 		 245 aa  227  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5286  transcriptional regulator, GntR family  51.05 
 
 		 243 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  43.57 
 
 		 242 aa  191  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0337  GntR family transcriptional regulator  88.1 
 
 		 105 aa  149  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.186811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 259 aa  95.1  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  28.99 
 
 		 261 aa  88.6  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  31.54 
 
 		 253 aa  87.8  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2323  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 263 aa  86.3  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0617255  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0474  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2169  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.02 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  29.67 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  29.69 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  30.9 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 247 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4653  transcriptional regulator, GntR family  45.56 
 
 		 145 aa  74.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  26.7 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  28.8 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4434  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 274 aa  72  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 274 aa  72  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3933  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 274 aa  72  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 274 aa  72  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0685  trehalose operon repressor  27.5 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.327487 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0597  trehalose operon transcriptional repressor  30.08 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.464881  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0541  trehalose operon transcriptional repressor  30.08 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0541  trehalose operon transcriptional repressor  30.08 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0630  trehalose operon transcriptional repressor  30.08 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3799  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392461  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2005  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00857221  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2707  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0952006 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4635  transcriptional regulator, GntR family  29.3 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000503298  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  29.8 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3031  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.37 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.921184 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4360  GntR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  27.31 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  27.31 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  25.35 
 
 		 256 aa  67  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0698  trehalose operon transcriptional repressor  29.27 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0724  transcriptional regulator, GntR family  30.63 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  27.56 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4063  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0543  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 236 aa  67  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4033  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  30.81 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0213  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  30.81 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0759  trehalose operon repressor  28.36 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2301  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3370  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1802  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0871111  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2171  GntR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3508  GntR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  32.9 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  30.91 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.533333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2167  putative transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>