61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2891 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2891  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 175 aa  346  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.423271  normal  0.177095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9120  putative transcriptional regulator, GntR family  39.64 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 237 aa  92.8  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 237 aa  90.9  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0144  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  39.24 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0151  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  39.24 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9121  putative transcriptional regulator, GntR family  36.67 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  35.03 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0011  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 240 aa  74.3  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 		 261 aa  67.8  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0719  putative transcriptional regulator, GntR family  28.78 
 
 		 268 aa  64.7  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2096  putative transcriptional regulator, GntR family  29.87 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1001  putative transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 295 aa  62  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  32.92 
 
 		 259 aa  62  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0797  putative GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.288105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  31.17 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  31.1 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3598  transcriptional regulator, GntR family  30.38 
 
 		 251 aa  54.7  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 261 aa  55.1  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 259 aa  54.7  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  33.81 
 
 		 242 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2896  putative transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 		 180 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407099  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 245 aa  50.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2890  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 257 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  26.51 
 
 		 257 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 254 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2323  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 263 aa  49.3  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0617255  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  31.71 
 
 		 253 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  30.25 
 
 		 238 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1749  transcriptional regulator, GntR family  29.2 
 
 		 249 aa  45.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.37809  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 241 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 274 aa  45.1  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4438  transcriptional regulator, GntR family  27.97 
 
 		 246 aa  45.1  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1234  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.27 
 
 		 272 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.550496  normal  0.0276711 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  30.56 
 
 		 278 aa  44.7  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5574  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  26.52 
 
 		 255 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  25.71 
 
 		 258 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 274 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  25.71 
 
 		 269 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  28.79 
 
 		 241 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 246 aa  43.5  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 271 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 274 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 332 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 376 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 266 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 266 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 266 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 266 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 266 aa  42  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 376 aa  42  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1280  transcriptional regulator, GntR family  29.69 
 
 		 233 aa  42  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0255  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  22.54 
 
 		 234 aa  41.6  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0249  GntR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 234 aa  41.6  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  27.07 
 
 		 274 aa  41.2  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 262 aa  41.2  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 308 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 278 aa  40.8  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2169  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.34 
 
 		 271 aa  40.8  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225688  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>