18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2896 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2896  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 180 aa  359  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407099  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 250 aa  88.6  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  35.26 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  34.81 
 
 		 261 aa  78.2  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  30.94 
 
 		 259 aa  71.2  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  32 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 261 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  31.14 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9120  putative transcriptional regulator, GntR family  31.36 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 252 aa  45.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2891  putative transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.423271  normal  0.177095 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5286  transcriptional regulator, GntR family  33.03 
 
 		 243 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  32.63 
 
 		 263 aa  42.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2096  putative transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 248 aa  41.2  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2005  transcriptional regulator, GntR family  33.07 
 
 		 249 aa  41.2  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00857221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>