More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2167 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2167  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 241 aa  478  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1078  GntR family transcriptional regulator  63.27 
 
 		 245 aa  295  4e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358733  hitchhiker  0.00355085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4811  transcriptional regulator, GntR family  38.33 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0033  GntR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 264 aa  136  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3598  transcriptional regulator, GntR family  38.06 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  35.51 
 
 		 261 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  35.51 
 
 		 263 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  33.75 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  32.91 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  34.26 
 
 		 259 aa  99.8  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 261 aa  97.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 250 aa  96.7  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  33.61 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0154  putative transcriptional regulator, GntR family  31.42 
 
 		 245 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  33.6 
 
 		 255 aa  85.9  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 252 aa  85.5  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  29.22 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  26.92 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  29.11 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1294  histidine utilization repressor  29 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0086  GntR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 126 aa  72  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  28.94 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  30.59 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0088  transcriptional regulator, GntR family  28.23 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0856057  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0429  histidine utilization repressor  26.58 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.245315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  23.65 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5035  histidine utilization repressor  26.58 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  29.39 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2096  putative transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 267 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1317  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  26.79 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  24.46 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4909  GntR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.429713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  26.03 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5085  histidine utilization repressor  26.58 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0046  transcriptional regulator, GntR family  30.33 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0366  histidine utilization repressor  26.36 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2647  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  27 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0358  histidine utilization repressor  25.74 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.824022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5286  transcriptional regulator, GntR family  26.5 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0700  putative transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7288  putative transcriptional regulator, GntR family  31.2 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.767574 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2005  transcriptional regulator, GntR family  29.24 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00857221  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5172  histidine utilization repressor  26.16 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2966  histidine utilization repressor  27.59 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665384  normal  0.740013 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2652  regulatory protein GntR, HTH  28.57 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  25.83 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1044  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.523425  normal  0.272848 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4068  GntR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1261  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  25.83 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  24.17 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3880  transcriptional regulator, GntR family  23.53 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000682902  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3905  GntR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  25.94 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0763  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.747826  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2581  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4518  transcriptional regulator, GntR family  27.13 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0769  transcriptional regulator, GntR family  27.13 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1687  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0718  putative transcriptional regulator, GntR family  28.87 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9121  putative transcriptional regulator, GntR family  27.53 
 
 		 244 aa  62  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2626  transcriptional regulator, GntR family  24.59 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000663973  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4653  transcriptional regulator, GntR family  45.95 
 
 		 145 aa  62  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5923  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  28.28 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.113874 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  28.09 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>