More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0086 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0086  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 126 aa  249  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8668  putative transcriptional regulator, GntR family  56.25 
 
 		 111 aa  120  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 254 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0033  GntR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 264 aa  74.3  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 259 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6358  transcriptional regulator, GntR family  48.48 
 
 		 127 aa  73.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2167  putative transcriptional regulator, GntR family  47.14 
 
 		 241 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2477  GntR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  43.59 
 
 		 253 aa  68.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3598  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 251 aa  67.8  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  46.03 
 
 		 254 aa  67.4  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  40.45 
 
 		 299 aa  67  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1108  transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3880  transcriptional regulator, GntR family  44 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000682902  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3509  GntR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393643  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0917  transcriptional regulator, GntR family  47.06 
 
 		 280 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3895  putative transcriptional regulator  39.76 
 
 		 249 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.221719  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4875  transcriptional regulator, GntR family  49.25 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4811  transcriptional regulator, GntR family  48.48 
 
 		 247 aa  64.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2930  transcriptional regulator, GntR family  45.59 
 
 		 259 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000160523  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0426  regulatory protein GntR HTH  45.31 
 
 		 243 aa  64.3  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0255  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  37.78 
 
 		 234 aa  64.3  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0249  GntR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 234 aa  64.3  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  44.93 
 
 		 241 aa  64.3  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2024  transcriptional regulator, GntR family  52.94 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.205752  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1078  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358733  hitchhiker  0.00355085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  48.57 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  49.21 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0299  regulatory protein GntR, HTH  47.14 
 
 		 79 aa  63.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1446  transcriptional regulator, GntR family  52.94 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0154  putative transcriptional regulator, GntR family  43.84 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0126  regulatory protein GntR HTH  31.78 
 
 		 251 aa  62  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0616081  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1119  GntR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0121  regulatory protein GntR, HTH  31.78 
 
 		 251 aa  62  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000430087  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  50.79 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9121  putative transcriptional regulator, GntR family  45.59 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1606  transcriptional regulator, GntR family  42.42 
 
 		 241 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000225231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8675  putative transcriptional regulator, GntR family  51.56 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0344  GntR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.392311  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0740  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 245 aa  61.6  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000268297  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3400  transcriptional regulator  43.28 
 
 		 442 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  37 
 
 		 241 aa  61.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 256 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1357  regulatory protein GntR, HTH  31.31 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  47.69 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0960  transcriptional regulator, GntR family  30.08 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 256 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 256 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 256 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 258 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4653  transcriptional regulator, GntR family  43.28 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04760  predicted transcriptional regulator  40.3 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0506039  normal  0.467802 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  36.84 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  41.89 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1410  GntR domain protein  48.28 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  41.1 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0724  transcriptional regulator, GntR family  35.62 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1572  GntR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289458 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  39.77 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15050  regulatory protein GntR HTH  41.33 
 
 		 368 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.34825  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1877  GntR domain protein  39.77 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380896  normal  0.264595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4179  regulatory protein GntR HTH  33.03 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  42.03 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0046  transcriptional regulator, GntR family  42.42 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  45.16 
 
 		 257 aa  57.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4331  regulatory protein GntR, HTH  47.69 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.157834  normal  0.0446909 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0374  GntR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0541  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000336324  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 242 aa  57.8  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3960  regulatory protein GntR, HTH  40 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 245 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 255 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  34.17 
 
 		 264 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  39.73 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1691  GntR domain protein  39.77 
 
 		 236 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2171  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 258 aa  57.4  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0303  GntR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 249 aa  57  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 245 aa  57  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  43.66 
 
 		 259 aa  57  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4518  transcriptional regulator, GntR family  44.62 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0769  transcriptional regulator, GntR family  44.62 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2197  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0345  regulatory protein GntR HTH  38.03 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.631612  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0072  regulatory protein GntR, HTH  49.23 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.476491  normal  0.750222 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0812  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  38.03 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4773  regulatory protein GntR HTH  46.15 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0230746  decreased coverage  0.0000199602 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  36.23 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>