More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8668 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8668  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 111 aa  217  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0086  GntR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 126 aa  120  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 254 aa  70.5  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  44 
 
 		 253 aa  67.8  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4875  transcriptional regulator, GntR family  49.25 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0033  GntR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6358  transcriptional regulator, GntR family  41.9 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  47.62 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3401  GntR domain-containing protein  43.84 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3664  GntR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.514259  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0917  transcriptional regulator, GntR family  45.59 
 
 		 280 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4653  transcriptional regulator, GntR family  43.28 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  42.27 
 
 		 235 aa  60.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  44.93 
 
 		 241 aa  60.5  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  45.07 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1357  regulatory protein GntR, HTH  29.29 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8675  putative transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  41.67 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0259  regulatory protein GntR, HTH  48.05 
 
 		 78 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0311021 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  44.29 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  45.45 
 
 		 299 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2167  putative transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 241 aa  58.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  47.54 
 
 		 250 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0426  regulatory protein GntR HTH  42.19 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 261 aa  57.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3953  regulatory protein GntR, HTH  40 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  42.86 
 
 		 240 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 240 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  42.86 
 
 		 240 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  42.86 
 
 		 240 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  42.86 
 
 		 240 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  42.42 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  42.86 
 
 		 240 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  46.77 
 
 		 257 aa  57.4  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9121  putative transcriptional regulator, GntR family  45.59 
 
 		 244 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0072  regulatory protein GntR, HTH  50 
 
 		 288 aa  57.4  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.476491  normal  0.750222 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2930  transcriptional regulator, GntR family  34.34 
 
 		 259 aa  57  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000160523  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0255  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  41.79 
 
 		 234 aa  57  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0249  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 234 aa  57  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 252 aa  57  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  44.12 
 
 		 240 aa  57  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  46.77 
 
 		 238 aa  57  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2024  transcriptional regulator, GntR family  47.14 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.205752  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2460  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 478 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3598  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4344  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 75 aa  57  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0366486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1606  transcriptional regulator, GntR family  41.18 
 
 		 241 aa  57  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000225231  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2483  transcriptional regulator  40.82 
 
 		 470 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0358309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0960  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1446  transcriptional regulator, GntR family  47.14 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0374  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1877  GntR domain protein  38.89 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380896  normal  0.264595 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1078  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358733  hitchhiker  0.00355085 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  37.14 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 308 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1108  transcriptional regulator, GntR family  37.62 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  28.42 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  31.43 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1537  putative GntR domain protein  36.99 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  31.43 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 258 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3400  transcriptional regulator  39.44 
 
 		 442 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.51 
 
 		 468 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2477  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 244 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 250 aa  54.7  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6745  GntR domain-containing protein  35.56 
 
 		 243 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 256 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 234 aa  54.3  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 256 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 256 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1691  GntR domain protein  40 
 
 		 236 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 256 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 259 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  41.11 
 
 		 253 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  40.85 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1076  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0019673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4956  GntR domain protein  43.48 
 
 		 258 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5148  GntR domain protein  45.16 
 
 		 258 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178203  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 256 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 256 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3960  regulatory protein GntR, HTH  41.27 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  43.66 
 
 		 242 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1572  GntR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 288 aa  53.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289458 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  40.45 
 
 		 242 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_004310  BR1100  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 253 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 249 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  37.65 
 
 		 262 aa  52.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 232 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 245 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  34.29 
 
 		 253 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>