More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0118 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 129 aa  251  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3903  GntR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000301963  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1549  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.478849  decreased coverage  0.0000058181 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  48.39 
 
 		 124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2275  transcriptional regulator, GntR family  48.41 
 
 		 126 aa  116  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00673812  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  47.66 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  47.66 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  49.19 
 
 		 129 aa  114  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  48.39 
 
 		 124 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  47.58 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1382  GntR family transcriptional regulator  48.36 
 
 		 125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00127899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  47.58 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  47.58 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  47.58 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  47.58 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  47.58 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  47.58 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  47.58 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0445  GntR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 123 aa  110  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0436  GntR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 123 aa  110  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2969  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.233568  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 125 aa  107  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  42.74 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  42.74 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1981  GntR family transcriptional regulator  45 
 
 		 128 aa  103  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2129  GntR family transcriptional regulator  45 
 
 		 128 aa  103  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.625758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2162  transcriptional regulator, GntR family  45 
 
 		 128 aa  103  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2650  transcriptional regulator, putative  43.8 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  43.44 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0191  transcriptional regulator, GntR family  44.35 
 
 		 125 aa  97.4  6e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2507  transcriptional regulator, GntR family  41.6 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0222  transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.672326  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  40.5 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 132 aa  85.5  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1824  transcriptional regulator, GntR family  38.98 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  40.98 
 
 		 128 aa  83.6  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  35.04 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  37.61 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2116  transcriptional regulator, GntR family  51.39 
 
 		 466 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1900  GntR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 466 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000823779  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0065  GntR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2184  transcriptional regulator, GntR family  52.17 
 
 		 466 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1890  GntR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 466 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0766739  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.71 
 
 		 472 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000690216  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07820  predicted transcriptional regulator  33.63 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  40.16 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 473 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2170  GntR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 466 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662886  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1938  GntR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 466 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2085  GntR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 466 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249037  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2075  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 471 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  42.5 
 
 		 464 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  46.58 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3873  GntR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1937  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 466 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1672  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.56 
 
 		 435 aa  71.6  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  45.1 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3230  transcriptional regulator, GntR family  48.61 
 
 		 471 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0073  GntR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138424  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 477 aa  71.2  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  41.24 
 
 		 121 aa  70.1  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2022  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.74 
 
 		 593 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  43.18 
 
 		 463 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  34.45 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  34.45 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  35.9 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  45.33 
 
 		 493 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  43.66 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3574  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  31.62 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0225  transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 520 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1243  transcriptional regulator, GntR family  45.59 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.157686  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0072  GntR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1834  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.33 
 
 		 467 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0688759  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4875  transcriptional regulator, GntR family  31.73 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0430  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2747  transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  32.79 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1900  hypothetical protein  42.17 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>