More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3873 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3873  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 119 aa  230  5e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  62.5 
 
 		 123 aa  116  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3399  transcriptional regulator, GntR family  62.39 
 
 		 117 aa  114  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0501245  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2572  transcriptional regulator, GntR family  58.88 
 
 		 120 aa  100  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  53.15 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1406  GntR family transcriptional regulator  57.01 
 
 		 124 aa  97.1  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.024195  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1368  transcriptional regulator, GntR family  51.4 
 
 		 119 aa  97.1  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4569  regulatory protein GntR, HTH  54.63 
 
 		 121 aa  94  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.320661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4945  transcriptional regulator protein-like protein  53.7 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.684518  normal  0.399116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1998  transcriptional regulator, GntR family  51.85 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0570  transcriptional regulator, GntR family  49.04 
 
 		 119 aa  91.7  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506154 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  54.62 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 121 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 133 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 133 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  62.86 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2078  GntR family transcriptional regulator  61.84 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202595  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11176  transcriptional regulator  47.11 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3017  GntR family transcriptional regulator  60.56 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11827  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21200  transcriptional regulator, GntR family  60.27 
 
 		 120 aa  83.6  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0814821 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1094  transcriptional regulator, GntR family  58.44 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1819  transcriptional regulator, GntR family  53.64 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000455222 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18240  transcriptional regulator, GntR family  64.62 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.41291  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  32.76 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  38.05 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  32.46 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07820  predicted transcriptional regulator  47.5 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  42.17 
 
 		 321 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  36.21 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  44.05 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2355  transcriptional regulator, GntR family  58.57 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  53.12 
 
 		 493 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2022  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  54.55 
 
 		 593 aa  67  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0938  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2599  transcriptional regulator, GntR family  44.66 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10292  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  44.33 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2747  transcriptional regulator, GntR family  47.22 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1480  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.321595  normal  0.897854 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1484  regulatory protein GntR HTH  50.55 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00605871  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  42.47 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  31.4 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1382  GntR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00127899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0225  transcriptional regulator, GntR family  29.57 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06740  predicted transcriptional regulator  48.61 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.581792  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4876  transcriptional regulator, GntR family  43.01 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0087  GntR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 525 aa  64.7  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1390  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000697536  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  28.7 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  30.97 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3903  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000301963  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2969  GntR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.233568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  31.82 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  40.28 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  31.82 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  45.21 
 
 		 463 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  32.46 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  39 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  33.94 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 547 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  43.48 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  49.25 
 
 		 484 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  33.94 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1209  transcriptional regulator, GntR family  38.74 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0188078 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 507 aa  62  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0445  GntR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0436  GntR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2376  transcriptional regulator, GntR family  29.75 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.2044  normal  0.545557 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1514  GntR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 444 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.508918 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2407  transcriptional regulator, GntR family  36.04 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00608999  normal  0.35427 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2507  transcriptional regulator, GntR family  44.29 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.33 
 
 		 464 aa  61.6  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  47.06 
 
 		 464 aa  61.6  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1243  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.157686  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  41.82 
 
 		 502 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 502 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 502 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2107  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  52.24 
 
 		 444 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957834  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>