More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0191 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0191  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 125 aa  248  2e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1549  GntR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 124 aa  115  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.478849  decreased coverage  0.0000058181 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2275  transcriptional regulator, GntR family  48 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00673812  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3903  GntR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000301963  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2969  GntR family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 124 aa  114  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.233568  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0445  GntR family transcriptional regulator  48.36 
 
 		 123 aa  113  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0436  GntR family transcriptional regulator  48.36 
 
 		 123 aa  113  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1382  GntR family transcriptional regulator  47.15 
 
 		 125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00127899  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  47.5 
 
 		 124 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  47.15 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  47.15 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  47.15 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  47.15 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  47.15 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  47.15 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  45.08 
 
 		 124 aa  104  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  45 
 
 		 124 aa  104  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2507  transcriptional regulator, GntR family  48.36 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1981  GntR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 128 aa  103  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 124 aa  103  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2129  GntR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 128 aa  103  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.625758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2162  transcriptional regulator, GntR family  43.2 
 
 		 128 aa  103  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  44.26 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  44.72 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  44.35 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  44.72 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0222  transcriptional regulator, GntR family  46.77 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.672326  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  44.35 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07820  predicted transcriptional regulator  41.94 
 
 		 126 aa  94.7  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2650  transcriptional regulator, putative  42.74 
 
 		 121 aa  84  7e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  38.66 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1900  hypothetical protein  51.19 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  37.1 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  32.77 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.62 
 
 		 461 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.214132 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0073  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138424  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 139 aa  67  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  35.43 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5513  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.62 
 
 		 461 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412768  decreased coverage  0.00050533 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3701  GntR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 478 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  32.73 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  32.2 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.68 
 
 		 490 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0087  GntR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 525 aa  64.3  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0065  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  33.87 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1297  GntR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 480 aa  62.8  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1824  transcriptional regulator, GntR family  42.65 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2363  GntR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 459 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  24.58 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  36.75 
 
 		 321 aa  60.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2235  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 117 aa  60.1  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  43.42 
 
 		 464 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 507 aa  59.3  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2407  transcriptional regulator, GntR family  24.35 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00608999  normal  0.35427 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.36 
 
 		 501 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 501 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  38.36 
 
 		 520 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3480  GntR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 481 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.16 
 
 		 517 aa  58.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  40.79 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0430  transcriptional regulator, GntR family  27.87 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  37.33 
 
 		 502 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  37.33 
 
 		 502 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  42.11 
 
 		 463 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 503 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 502 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 502 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 502 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>