More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2650 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2650  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 121 aa  242  9.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0445  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 123 aa  121  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0436  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 123 aa  121  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2275  transcriptional regulator, GntR family  48.76 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00673812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2969  GntR family transcriptional regulator  47.01 
 
 		 124 aa  115  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.233568  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3903  GntR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 124 aa  112  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000301963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 129 aa  110  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 		 129 aa  110  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  45.45 
 
 		 129 aa  110  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 129 aa  110  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 129 aa  110  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 		 129 aa  110  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1549  GntR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 124 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.478849  decreased coverage  0.0000058181 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  43.8 
 
 		 129 aa  107  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  42.15 
 
 		 124 aa  103  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2162  transcriptional regulator, GntR family  44.17 
 
 		 128 aa  103  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1981  GntR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 128 aa  103  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2129  GntR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 128 aa  103  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.625758  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  42.15 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  42.15 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0222  transcriptional regulator, GntR family  39.83 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.672326  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1382  GntR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 125 aa  97.8  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00127899  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 124 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2507  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 125 aa  97.1  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  38.84 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 124 aa  95.1  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 124 aa  95.1  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 124 aa  95.1  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  38.02 
 
 		 124 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  38.02 
 
 		 124 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0191  transcriptional regulator, GntR family  42.74 
 
 		 125 aa  94  6e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  38.02 
 
 		 124 aa  90.1  9e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  35.77 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  35.34 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  38.84 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  32.76 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07820  predicted transcriptional regulator  36.75 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  37.27 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  43.42 
 
 		 464 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.77 
 
 		 472 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000690216  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  35.35 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0065  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  43.42 
 
 		 463 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3574  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 321 aa  64.3  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  36.67 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1900  hypothetical protein  38.75 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0157  GntR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 454 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.790011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1297  GntR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 480 aa  62.8  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  42.47 
 
 		 463 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2337  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4863  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  28.1 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  28.95 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.47 
 
 		 464 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  30.97 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2235  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0087  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 525 aa  60.8  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0646  GntR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 473 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15050  regulatory protein GntR HTH  40.54 
 
 		 368 aa  60.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.34825  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1357  regulatory protein GntR, HTH  30.77 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1824  transcriptional regulator, GntR family  39.73 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2022  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.67 
 
 		 593 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1890  GntR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 466 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0766739  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  31.48 
 
 		 477 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  36.08 
 
 		 482 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  36.08 
 
 		 482 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0069  regulatory protein GntR, HTH  29.57 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0075  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0073  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0077  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256514 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0072  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  36.08 
 
 		 482 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 482 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 477 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 482 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  36.08 
 
 		 482 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 482 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0058  regulatory protein GntR, HTH  31.86 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2769  transcriptional regulator  38.61 
 
 		 463 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0620  transcriptional regulator, GntR family  40.59 
 
 		 466 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 554 aa  58.5  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2170  GntR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 466 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662886  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1900  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 466 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000823779  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2116  transcriptional regulator, GntR family  39.53 
 
 		 466 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  31.46 
 
 		 477 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0989  transcriptional regulator  43.94 
 
 		 473 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0129526  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2075  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 471 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  33.75 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>