More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2775 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 
139 aa  283  5e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  84.89 
 
 
139 aa  253  8e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  84.89 
 
 
139 aa  253  8e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  83.45 
 
 
139 aa  251  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  83.45 
 
 
139 aa  249  6e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  82.73 
 
 
139 aa  249  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  82.73 
 
 
139 aa  249  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  82.01 
 
 
139 aa  248  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  81.29 
 
 
139 aa  247  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  82.01 
 
 
139 aa  246  5e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  82.01 
 
 
139 aa  246  5e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  44.09 
 
 
128 aa  111  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1824  transcriptional regulator, GntR family  44.53 
 
 
138 aa  107  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  41.73 
 
 
125 aa  104  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  43.09 
 
 
138 aa  101  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  42.24 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  46.9 
 
 
126 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  42.28 
 
 
125 aa  95.1  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  41.46 
 
 
126 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  41.46 
 
 
126 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  46.9 
 
 
121 aa  94  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0050  GntR family transcriptional regulator  40.87 
 
 
121 aa  93.2  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.898353  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  43.86 
 
 
129 aa  90.9  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
120 aa  88.6  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1382  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
125 aa  88.2  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00127899  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  37.9 
 
 
126 aa  87.8  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1549  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
124 aa  87.4  7e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.478849  decreased coverage  0.0000058181 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  36.07 
 
 
124 aa  86.3  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  40.77 
 
 
128 aa  85.9  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2275  transcriptional regulator, GntR family  39.02 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00673812  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  39.82 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  39.82 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  39.82 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  39.82 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  39.82 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  39.82 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  39.82 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  35.25 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  36.29 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  38.94 
 
 
126 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  38.94 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3903  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000301963  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  38.98 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  38.94 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  38.94 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  35.54 
 
 
115 aa  77.4  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 
120 aa  77  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0445  GntR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
123 aa  76.6  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0436  GntR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
123 aa  76.6  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
130 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  46.67 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1243  transcriptional regulator, GntR family  47.37 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.157686  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2154  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07820  predicted transcriptional regulator  34.19 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 
131 aa  74.3  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  46.05 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1359  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 
123 aa  74.3  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.428483 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1803  GntR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
123 aa  74.3  0.0000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  34.71 
 
 
321 aa  73.9  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  33.33 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  37.7 
 
 
121 aa  73.6  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2000  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
118 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
121 aa  73.6  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  39.51 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4863  GntR family transcriptional regulator  38.21 
 
 
125 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0430  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2285  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
118 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1621  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
123 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1981  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2129  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.625758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2162  transcriptional regulator, GntR family  36.59 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8884  transcriptional regulator, GntR family  28.46 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2507  transcriptional regulator, GntR family  38.14 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1332  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
127 aa  72  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  32.77 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1122  transcriptional regulator, GntR family  36.75 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379756 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  43.42 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0191  transcriptional regulator, GntR family  32.77 
 
 
125 aa  70.1  0.000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
121 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1515  regulatory protein GntR, HTH  35.78 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  29.37 
 
 
127 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>