More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2337 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2337  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 119 aa  240  3.9999999999999997e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  50.45 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  46.09 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  49.14 
 
 		 125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  41.59 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  40.71 
 
 		 126 aa  103  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 126 aa  103  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1919  transcriptional regulator, GntR family  43.36 
 
 		 129 aa  103  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  39.82 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  39.82 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  39.82 
 
 		 126 aa  102  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1279  GntR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00230471  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 124 aa  98.6  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1629  transcriptional regulator, GntR family  40.18 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 126 aa  97.4  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1515  regulatory protein GntR, HTH  42.34 
 
 		 120 aa  97.4  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1402  GntR family transcriptional regulator, putative  41.67 
 
 		 125 aa  97.4  5e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0938  GntR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0169  transcriptional regulator, GntR family  41.59 
 
 		 123 aa  90.1  9e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 133 aa  87  7e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2547  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.136131  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1621  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1824  transcriptional regulator, GntR family  40.18 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  36.94 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  41.44 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0365  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  42.61 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  36.97 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1108  transcriptional regulator  33.88 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0952489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3352  regulatory protein GntR HTH  46.67 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2235  GntR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7289  transcriptional regulator, GntR family  43.37 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1007  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  30.43 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  46.58 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  36.07 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1243  transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 		 137 aa  70.1  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.157686  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2000  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2285  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1122  transcriptional regulator, GntR family  42.67 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379756 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0430  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1803  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  36.28 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  41.57 
 
 		 137 aa  67  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2154  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0107  transcriptional regulator, GntR family  26.85 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5187  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0445  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0436  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  45.59 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  45.59 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  45.59 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  45.59 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  28.32 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  36.97 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  35.16 
 
 		 464 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1359  transcriptional regulator, GntR family  28.83 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.428483 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04510  regulatory protein GntR HTH  32.79 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1206  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0894307 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3903  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000301963  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1272  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0653  transcriptional regulator, GntR family  27.52 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.90305  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  37.17 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  45.45 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 547 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1209  transcriptional regulator, GntR family  25.45 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0188078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1345  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  25.24 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1382  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00127899  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4863  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1229  transcriptional regulator, GntR family  25.74 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2376  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.2044  normal  0.545557 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  29.81 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0185  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2507  transcriptional regulator, GntR family  42.03 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0222  transcriptional regulator, GntR family  30.17 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.672326  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 477 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3575  transcriptional regulator, GntR family  28.7 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00235324  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2969  GntR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.233568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>