More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3352 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3352  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 124 aa  256  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1122  transcriptional regulator, GntR family  57.72 
 
 		 125 aa  158  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7289  transcriptional regulator, GntR family  59.35 
 
 		 123 aa  155  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5187  transcriptional regulator, GntR family  57.38 
 
 		 126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_002950  PG1007  GntR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  40.54 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2337  transcriptional regulator, GntR family  46.67 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07005  hypothetical protein  31.78 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0938  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04510  regulatory protein GntR HTH  38.39 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  35.45 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  40.79 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  40.79 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  40.79 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1515  regulatory protein GntR, HTH  42.47 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000965  transcriptional regulator GntR family  30.84 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  40.79 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  34.96 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1559  transcriptional regulator, GntR family  37.04 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1108  transcriptional regulator  34.17 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0952489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0076  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  33.61 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  42.11 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1629  transcriptional regulator, GntR family  38.36 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2945  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315023  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2634  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00782758  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2657  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000366094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2908  putative transcriptional regulator  36.11 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000437446 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1173  GntR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.497772  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0823  transcriptional regulator, GntR family  30.91 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.609388  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2324  putative transcriptional regulator  35.19 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.665788  hitchhiker  0.000002965 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2712  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.902974  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04760  predicted transcriptional regulator  30.7 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0506039  normal  0.467802 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0185  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2235  GntR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0449  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2609  transcriptional regulator, GntR family  28.18 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01221  transcriptional regulator GntR family  31.65 
 
 		 97 aa  62  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189033  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  33.61 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0952  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.091739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1337  transcriptional regulator, GntR family  37.21 
 
 		 131 aa  62  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1332  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0164  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06980  transcriptional regulator, GntR family  31.13 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1919  transcriptional regulator, GntR family  37.37 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  43.28 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2154  GntR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1279  GntR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 125 aa  60.1  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00230471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1357  regulatory protein GntR, HTH  36.11 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  31.67 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  31.67 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2547  transcriptional regulator, GntR family  29.73 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.136131  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0169  transcriptional regulator, GntR family  36.04 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  34.95 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 477 aa  58.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 477 aa  58.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  35.05 
 
 		 477 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  36.23 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6591  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30942  normal  0.691161 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  35.05 
 
 		 477 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2569  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.58934  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  35.05 
 
 		 477 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3525  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 477 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2708  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.159908  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1243  transcriptional regulator, GntR family  40.28 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.157686  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2285  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2000  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1359  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.428483 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1824  transcriptional regulator, GntR family  36.99 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 477 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2889  transcriptional regulator, GntR family  33.72 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1803  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1480  transcriptional regulator, GntR family  39.19 
 
 		 321 aa  54.7  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.321595  normal  0.897854 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1402  GntR family transcriptional regulator, putative  41.1 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0374  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1206  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0894307 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2227  transcriptional regulator, GntR family  28.38 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  hitchhiker  0.00687189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>