More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_07005 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_07005  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  338  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000965  transcriptional regulator GntR family  90.24 
 
 		 123 aa  230  6e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  48.25 
 
 		 119 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0823  transcriptional regulator, GntR family  46.02 
 
 		 113 aa  114  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.609388  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1173  GntR family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 113 aa  114  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.497772  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3525  GntR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 120 aa  104  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0449  GntR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 119 aa  98.2  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01221  transcriptional regulator GntR family  47.92 
 
 		 97 aa  95.9  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189033  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2982  GntR family transcriptional regulator  50.59 
 
 		 118 aa  94.4  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.583811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0164  GntR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5187  transcriptional regulator, GntR family  38.14 
 
 		 126 aa  91.3  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2609  transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 		 122 aa  90.9  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0952  GntR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 115 aa  86.7  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.091739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0185  GntR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0076  GntR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 115 aa  86.3  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3111  transcriptional regulator, GntR family  33.9 
 
 		 134 aa  85.5  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165856 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1559  transcriptional regulator, GntR family  35.65 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04760  predicted transcriptional regulator  35.29 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0506039  normal  0.467802 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04510  regulatory protein GntR HTH  38.53 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4757  transcriptional regulator, GntR family  36.11 
 
 		 141 aa  80.1  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1332  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4731  transcriptional regulator, GntR family  38.18 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2945  GntR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315023  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1122  transcriptional regulator, GntR family  31.36 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379756 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2657  GntR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000366094  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2634  GntR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00782758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2908  putative transcriptional regulator  38.68 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000437446 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2324  putative transcriptional regulator  38.68 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.665788  hitchhiker  0.000002965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7289  transcriptional regulator, GntR family  34.19 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2712  GntR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.902974  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1007  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2569  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.58934  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0486  transcriptional regulator, GntR family  39.81 
 
 		 122 aa  77  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.78271 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1359  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.428483 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1206  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0894307 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3352  regulatory protein GntR HTH  31.78 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1337  transcriptional regulator, GntR family  35.09 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0188  transcriptional regulator, GntR family  36.04 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428204  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2889  transcriptional regulator, GntR family  32.73 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 124 aa  72  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02920  predicted transcriptional regulator  35 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 124 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  29.27 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  30.89 
 
 		 124 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  41.57 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0445  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0436  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39240  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0413  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 120 aa  70.5  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126119  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  30.89 
 
 		 124 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3323  transcriptional regulator, GntR family  34.26 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3779  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2708  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 90 aa  67.4  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.159908  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  43.48 
 
 		 554 aa  65.9  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3903  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000301963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  29.52 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2969  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.233568  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  29.52 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  29.52 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  28.07 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0075  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0073  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0077  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256514 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  38.89 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 244 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0274  transcriptional regulator, GntR family  34.45 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  42.42 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 125 aa  63.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2836  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  32.43 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  43.94 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  32.43 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  32.43 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3574  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0222  transcriptional regulator, GntR family  29.82 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.672326  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3976  transcriptional regulator, GntR family protein  34.62 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2885  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  36.49 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0077  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0072  regulatory protein GntR HTH  34.86 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  33.63 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4277  regulatory protein GntR, HTH  34.86 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1106  transcriptional regulator, GntR family  40.58 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.866665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>