More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1108 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1108  transcriptional regulator  100 
 
 		 122 aa  243  6.999999999999999e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0952489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  40.98 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 126 aa  103  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 126 aa  103  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 126 aa  103  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 126 aa  103  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 126 aa  103  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 126 aa  103  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  36.67 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  40.35 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  38.33 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1515  regulatory protein GntR, HTH  39.32 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  37.72 
 
 		 125 aa  90.9  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  41.44 
 
 		 120 aa  88.2  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2000  GntR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 118 aa  87  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2285  GntR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 118 aa  86.7  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 124 aa  85.5  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1629  transcriptional regulator, GntR family  39.29 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1279  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00230471  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2154  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 133 aa  80.1  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0169  transcriptional regulator, GntR family  37.29 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0938  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2337  transcriptional regulator, GntR family  33.88 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1122  transcriptional regulator, GntR family  36.19 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379756 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  36.52 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  36.94 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1272  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  36.44 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  40.37 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7289  transcriptional regulator, GntR family  35.25 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2235  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5187  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1919  transcriptional regulator, GntR family  34.58 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  42.86 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3352  regulatory protein GntR HTH  34.17 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0365  transcriptional regulator, GntR family  32.46 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2547  transcriptional regulator, GntR family  34.51 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.136131  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1382  GntR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00127899  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  36.11 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  42.03 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  30.63 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0065  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  27.42 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  34.48 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4731  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0664  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0430  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1621  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4863  GntR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2647  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  35.4 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1332  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1390  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000697536  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1402  GntR family transcriptional regulator, putative  31.67 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  44.59 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  32.11 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1106  transcriptional regulator, GntR family  32.73 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.866665  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1357  regulatory protein GntR, HTH  35.96 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  36.36 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  35.85 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1007  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  35.45 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0960  transcriptional regulator, GntR family  35.56 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1209  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0188078 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 547 aa  62  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3399  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0501245  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1981  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2129  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.625758  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  31.62 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2162  transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  31.68 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2407  transcriptional regulator, GntR family  32.46 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00608999  normal  0.35427 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3779  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 321 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  30.77 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  30.77 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>