More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3223 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 
115 aa  222  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1106  transcriptional regulator, GntR family  62.96 
 
 
125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.866665  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  49.57 
 
 
116 aa  114  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  54.46 
 
 
117 aa  111  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1209  transcriptional regulator, GntR family  58.56 
 
 
118 aa  105  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0188078 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  62.2 
 
 
117 aa  105  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0051  transcriptional regulator protein-like protein  55.56 
 
 
121 aa  100  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0107  transcriptional regulator, GntR family  51.46 
 
 
126 aa  99.8  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1272  GntR family transcriptional regulator  46.73 
 
 
132 aa  92.8  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2647  GntR family transcriptional regulator  43.93 
 
 
115 aa  89  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423424  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  35.54 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  35.54 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  33.63 
 
 
129 aa  80.5  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  35.54 
 
 
139 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
139 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
139 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
139 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  35.54 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  34.86 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  36.04 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  35.54 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  31.53 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  36.54 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1229  transcriptional regulator, GntR family  37.84 
 
 
305 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
554 aa  75.5  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4641  GntR family transcriptional regulator  42.72 
 
 
115 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1108  transcriptional regulator  36.94 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0952489  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4277  regulatory protein GntR, HTH  35.59 
 
 
123 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3779  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
126 aa  72  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0072  regulatory protein GntR HTH  35.59 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0077  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0074  transcriptional regulator, GntR family  35.59 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0058  regulatory protein GntR, HTH  33.9 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  30.25 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  30.91 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  30.09 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  38.1 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1359  transcriptional regulator, GntR family  37.04 
 
 
123 aa  68.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.428483 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  38.1 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2275  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00673812  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  38.1 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  33.06 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  30.83 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0072  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000965  transcriptional regulator GntR family  35.24 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0075  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0073  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1390  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000697536  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0077  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000256514 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  36.63 
 
 
120 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07005  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  32.74 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  32.73 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  32.74 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  35.45 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  36.9 
 
 
126 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1382  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00127899  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2747  transcriptional regulator, GntR family  43.02 
 
 
165 aa  67  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
480 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  31.3 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2000  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
118 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0664  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2285  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3976  transcriptional regulator, GntR family protein  38.68 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1998  transcriptional regulator, GntR family  37.19 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2154  GntR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  29.57 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1549  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.478849  decreased coverage  0.0000058181 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0374  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21200  transcriptional regulator, GntR family  43.75 
 
 
120 aa  64.3  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0814821 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  40 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0225  transcriptional regulator, GntR family  30.36 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>