More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02090 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  320  5e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2407  transcriptional regulator, GntR family  66.25 
 
 		 159 aa  203  8e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00608999  normal  0.35427 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2376  transcriptional regulator, GntR family  42.4 
 
 		 131 aa  127  7.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.2044  normal  0.545557 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  43.2 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  42.52 
 
 		 133 aa  111  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  45.08 
 
 		 128 aa  107  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  43.24 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0653  transcriptional regulator, GntR family  37.17 
 
 		 128 aa  89.7  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.90305  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0073  GntR family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138424  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  33.91 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  47.06 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1229  transcriptional regulator, GntR family  37.96 
 
 		 305 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1390  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000697536  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2929  GntR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 328 aa  75.1  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.665926  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  31.45 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  31.45 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  31.45 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  31.45 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3464  GntR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  31.58 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  32.77 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2747  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1824  transcriptional regulator, GntR family  41.89 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01531  putative transcriptional regulator  35.9 
 
 		 329 aa  71.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  34.91 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  30.47 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0130  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.389862  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0083  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  30.91 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1730  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.577287  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17651  putative transcriptional regulator  35.53 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  30.43 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  44.74 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  30.97 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  30.97 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18261  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 328 aa  68.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606891  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18281  putative transcriptional regulator  35.53 
 
 		 328 aa  68.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18471  putative transcriptional regulator  35.53 
 
 		 328 aa  68.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1216  GntR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 329 aa  67.8  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0960  transcriptional regulator, GntR family  37 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20911  putative transcriptional regulator  25.76 
 
 		 329 aa  67.4  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.605524  normal  0.66693 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  34.82 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0938  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  28.7 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0090  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  30.09 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3734  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00205415  normal  0.192396 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.51 
 
 		 468 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2275  transcriptional regulator, GntR family  30.28 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00673812  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  25 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  26.89 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  30.91 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  25 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  41.89 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1106  transcriptional regulator, GntR family  37.04 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.866665  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1357  regulatory protein GntR, HTH  35.29 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  38.96 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0374  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3775  transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 		 329 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  28.8 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8884  transcriptional regulator, GntR family  33.9 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3826  transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 		 329 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28204  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1981  GntR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2129  GntR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.625758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2162  transcriptional regulator, GntR family  27.83 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1082  transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 		 325 aa  64.3  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.864397 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  28.97 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5482  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0115562 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  47.95 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0664  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1382  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00127899  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  24.6 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 475 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2507  transcriptional regulator, GntR family  36.11 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2238  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 		 331 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  38.24 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>