More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0793 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
120 aa  240  5e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2154  GntR family transcriptional regulator  77.78 
 
 
125 aa  193  7e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  45.87 
 
 
121 aa  98.6  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  43 
 
 
125 aa  90.1  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1108  transcriptional regulator  41.44 
 
 
122 aa  88.2  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0952489  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2000  GntR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
118 aa  84.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2285  GntR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
118 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 
121 aa  82  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  43.14 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1515  regulatory protein GntR, HTH  38.89 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
126 aa  82  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  39.18 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0365  transcriptional regulator, GntR family  37.61 
 
 
117 aa  80.1  0.000000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  40.23 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1629  transcriptional regulator, GntR family  41.05 
 
 
121 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  35.59 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2227  transcriptional regulator, GntR family  39.32 
 
 
129 aa  77.4  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  hitchhiker  0.00687189 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  36.27 
 
 
139 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  38.33 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  35.04 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0938  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  37.74 
 
 
119 aa  74.7  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1279  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
125 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00230471  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1621  GntR family transcriptional regulator  38 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6591  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30942  normal  0.691161 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  36.36 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  50.77 
 
 
137 aa  72  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0430  transcriptional regulator, GntR family  38.18 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  33.05 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0664  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1402  GntR family transcriptional regulator, putative  36.52 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  47.3 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0374  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1243  transcriptional regulator, GntR family  42.5 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.157686  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  33.04 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2337  transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  36.63 
 
 
115 aa  67.8  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
321 aa  67.4  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8884  transcriptional regulator, GntR family  44.62 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0107  transcriptional regulator, GntR family  40.74 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0050  GntR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.898353  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2407  transcriptional regulator, GntR family  32.38 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00608999  normal  0.35427 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  37.93 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  40.51 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3575  transcriptional regulator, GntR family  44.93 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00235324  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  42.11 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.3 
 
 
468 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1106  transcriptional regulator, GntR family  34.91 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.866665  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  36.36 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2547  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.136131  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0960  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 
120 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  33.61 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  46.15 
 
 
245 aa  65.1  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1345  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117764  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  32.79 
 
 
122 aa  64.3  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0882  transcriptional regulator, GntR family  36.08 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.905481  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
506 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
506 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
506 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
509 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
506 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
506 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1919  transcriptional regulator, GntR family  34.91 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11176  transcriptional regulator  33.62 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  34.55 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
506 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01221  transcriptional regulator GntR family  39.33 
 
 
97 aa  63.5  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189033  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0774  regulatory protein GntR HTH  45.45 
 
 
227 aa  63.9  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  32.2 
 
 
126 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  35.06 
 
 
126 aa  63.5  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0144797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>