More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1272 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1272  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 132 aa  253  7e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2647  GntR family transcriptional regulator  70.43 
 
 		 115 aa  164  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1106  transcriptional regulator, GntR family  49.57 
 
 		 125 aa  94  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.866665  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  46.73 
 
 		 115 aa  92.8  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1209  transcriptional regulator, GntR family  47.06 
 
 		 118 aa  90.1  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0188078 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 116 aa  89.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  46.09 
 
 		 117 aa  88.6  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0051  transcriptional regulator protein-like protein  48.15 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0107  transcriptional regulator, GntR family  42.02 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4641  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  39.47 
 
 		 117 aa  76.6  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  29.46 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  37.82 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1108  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0952489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  32.76 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3575  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00235324  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1345  GntR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  38 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  31.58 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0075  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0073  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0077  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256514 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0072  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  32.28 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  28 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1359  transcriptional regulator, GntR family  33.9 
 
 		 123 aa  67  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.428483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2000  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3796  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.48 
 
 		 471 aa  64.7  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 		 252 aa  64.7  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2285  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3779  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1229  transcriptional regulator, GntR family  37.17 
 
 		 305 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0077  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  31.9 
 
 		 321 aa  63.9  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0072  regulatory protein GntR HTH  34.48 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  43.04 
 
 		 241 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  40.79 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0664  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0426  regulatory protein GntR HTH  38.61 
 
 		 243 aa  63.9  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0074  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4277  regulatory protein GntR, HTH  34.48 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3976  transcriptional regulator, GntR family protein  34.75 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0917  transcriptional regulator, GntR family  39.78 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  41.18 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4863  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0707  transcriptional regulator, GntR family  38 
 
 		 254 aa  62  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0069  regulatory protein GntR, HTH  37.39 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1332  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1966  transcriptional regulator  39.76 
 
 		 454 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.138243  normal  0.104456 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2337  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  29.46 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6591  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30942  normal  0.691161 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2547  transcriptional regulator, GntR family  30.16 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.136131  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  36.36 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  33.86 
 
 		 245 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0058  regulatory protein GntR, HTH  34.48 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  34.41 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  40.51 
 
 		 498 aa  61.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  37.66 
 
 		 554 aa  61.2  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  38.61 
 
 		 243 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2626  transcriptional regulator, GntR family  36.7 
 
 		 256 aa  60.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000663973  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3399  transcriptional regulator, GntR family  47.37 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0501245  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6358  transcriptional regulator, GntR family  41.03 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 496 aa  60.8  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2420  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103399  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  34.86 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  36.61 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2625  transcriptional regulator, GntR family  36.63 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0476677  hitchhiker  0.0068543 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  28.46 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0374  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.62 
 
 		 468 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>