More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2352 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
121 aa  241  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  50.43 
 
 
126 aa  136  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  50.86 
 
 
126 aa  136  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  50.86 
 
 
126 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  50.86 
 
 
126 aa  135  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  50.86 
 
 
126 aa  135  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  50.86 
 
 
126 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  50.86 
 
 
126 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  50.86 
 
 
126 aa  135  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  50.86 
 
 
126 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  51.28 
 
 
121 aa  134  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  50 
 
 
126 aa  133  9e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  50.43 
 
 
126 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2337  transcriptional regulator, GntR family  46.09 
 
 
119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1279  GntR family transcriptional regulator  38.79 
 
 
125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00230471  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0938  GntR family transcriptional regulator  47.32 
 
 
122 aa  108  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1919  transcriptional regulator, GntR family  44.83 
 
 
129 aa  108  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1629  transcriptional regulator, GntR family  43.93 
 
 
121 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1515  regulatory protein GntR, HTH  47.11 
 
 
120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  44.07 
 
 
125 aa  107  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1108  transcriptional regulator  40.35 
 
 
122 aa  99  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0952489  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
133 aa  98.2  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0365  transcriptional regulator, GntR family  38.53 
 
 
117 aa  97.1  7e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1402  GntR family transcriptional regulator, putative  42.34 
 
 
125 aa  95.5  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0169  transcriptional regulator, GntR family  42.98 
 
 
123 aa  94.4  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2547  transcriptional regulator, GntR family  40.18 
 
 
123 aa  92.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.136131  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1621  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
123 aa  91.3  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2285  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
118 aa  90.5  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2000  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
118 aa  90.5  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 
120 aa  82  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  37.17 
 
 
129 aa  82  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  36.29 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  36.21 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  36.21 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  36.21 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  36.21 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  36.44 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0430  transcriptional regulator, GntR family  32.74 
 
 
130 aa  77.8  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2154  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
125 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3575  transcriptional regulator, GntR family  33.61 
 
 
130 aa  76.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00235324  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  32.5 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  31.2 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_002950  PG1007  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3852  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
324 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.62358  normal  0.635405 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
321 aa  71.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  47.76 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1122  transcriptional regulator, GntR family  34.55 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379756 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1824  transcriptional regulator, GntR family  37.39 
 
 
138 aa  70.1  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1243  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 
137 aa  70.1  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.157686  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0050  GntR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
121 aa  70.1  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.898353  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  35.9 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4757  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  41.1 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1549  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.478849  decreased coverage  0.0000058181 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3111  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6591  GntR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30942  normal  0.691161 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  30.63 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  30.33 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  30.63 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2235  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0653  transcriptional regulator, GntR family  29.52 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.90305  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3352  regulatory protein GntR HTH  42.11 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1345  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117764  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
125 aa  67  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  28.45 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  41.56 
 
 
126 aa  67  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  37.7 
 
 
121 aa  67  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
121 aa  67  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1297  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
480 aa  67  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  32.79 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0541  regulatory protein GntR HTH  32.93 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000336324  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0960  transcriptional regulator, GntR family  36.78 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1357  regulatory protein GntR, HTH  33.33 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7289  transcriptional regulator, GntR family  37.84 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0664  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
547 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  41.89 
 
 
463 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0073  GntR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138424  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5187  transcriptional regulator, GntR family  42.03 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  44.29 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3574  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 
123 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2075  transcriptional regulator, GntR family  37.78 
 
 
471 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>