More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1991 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  100 
 
 
126 aa  253  5e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 
126 aa  253  5e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  80.65 
 
 
125 aa  205  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  52.38 
 
 
129 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  52.38 
 
 
129 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  52.38 
 
 
129 aa  135  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  52.38 
 
 
129 aa  135  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  52.38 
 
 
129 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 
124 aa  135  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 
124 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  52 
 
 
129 aa  133  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  49.19 
 
 
124 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  49.19 
 
 
124 aa  133  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  49.19 
 
 
124 aa  133  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  49.19 
 
 
124 aa  133  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  49.19 
 
 
124 aa  133  8e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  49.19 
 
 
124 aa  133  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  49.19 
 
 
124 aa  133  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  49.19 
 
 
124 aa  133  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1382  GntR family transcriptional regulator  47.58 
 
 
125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00127899  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2275  transcriptional regulator, GntR family  48.78 
 
 
126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00673812  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1549  GntR family transcriptional regulator  45.97 
 
 
124 aa  120  4e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.478849  decreased coverage  0.0000058181 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2969  GntR family transcriptional regulator  42.74 
 
 
124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.233568  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3903  GntR family transcriptional regulator  42.74 
 
 
124 aa  110  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000301963  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2507  transcriptional regulator, GntR family  45.97 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0445  GntR family transcriptional regulator  43.44 
 
 
123 aa  107  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0436  GntR family transcriptional regulator  43.44 
 
 
123 aa  107  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0222  transcriptional regulator, GntR family  40.8 
 
 
127 aa  107  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.672326  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  42.74 
 
 
129 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1981  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
128 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2129  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
128 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.625758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2162  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 
128 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0191  transcriptional regulator, GntR family  44.72 
 
 
125 aa  101  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2650  transcriptional regulator, putative  42.15 
 
 
121 aa  99.4  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07820  predicted transcriptional regulator  40.32 
 
 
126 aa  99.8  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  41.46 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  39.32 
 
 
124 aa  92  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
139 aa  90.1  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
139 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  37.4 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  37.4 
 
 
139 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  37.4 
 
 
139 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  37.4 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
139 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
139 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
139 aa  87.4  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
129 aa  83.2  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0065  GntR family transcriptional regulator  53.73 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1900  hypothetical protein  43.37 
 
 
84 aa  77.8  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2285  GntR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
118 aa  77.4  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2000  GntR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
118 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  36.75 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  36.75 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  36.75 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  39.09 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0073  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138424  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 
133 aa  75.1  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  39.24 
 
 
479 aa  74.7  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.02 
 
 
490 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 
477 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  35.65 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  37.23 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 
477 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  39.24 
 
 
477 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 
477 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  43.42 
 
 
547 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 
477 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  37.97 
 
 
477 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  34.55 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  45.21 
 
 
247 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  50.77 
 
 
132 aa  72  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  42.59 
 
 
129 aa  72  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 
117 aa  72  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 
119 aa  72  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1209  transcriptional regulator, GntR family  37.23 
 
 
118 aa  71.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0188078 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  37.97 
 
 
477 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2769  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
477 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000296805  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  36.96 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
321 aa  71.2  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2407  transcriptional regulator, GntR family  26.55 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00608999  normal  0.35427 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  33.64 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 
128 aa  70.1  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  34.71 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  38.78 
 
 
122 aa  70.1  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15050  regulatory protein GntR HTH  37.96 
 
 
368 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.34825  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  34.51 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1390  GntR family transcriptional regulator  45.59 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000697536  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  30.63 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  37.72 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>