More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2620 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 119 aa  240  3.9999999999999997e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01221  transcriptional regulator GntR family  90.53 
 
 		 97 aa  175  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189033  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3525  GntR family transcriptional regulator  53.51 
 
 		 120 aa  133  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0449  GntR family transcriptional regulator  53.64 
 
 		 119 aa  120  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2982  GntR family transcriptional regulator  59.78 
 
 		 118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.583811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1173  GntR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 113 aa  117  6e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.497772  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0823  transcriptional regulator, GntR family  42.34 
 
 		 113 aa  117  6e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.609388  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000965  transcriptional regulator GntR family  48.67 
 
 		 123 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07005  hypothetical protein  48.25 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0164  GntR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 129 aa  103  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0952  GntR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 115 aa  103  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.091739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0076  GntR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2569  transcriptional regulator, GntR family  35.4 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.58934  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1206  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0894307 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3574  GntR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4731  transcriptional regulator, GntR family  35.51 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3976  transcriptional regulator, GntR family protein  39.64 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  36.79 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3779  GntR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1122  transcriptional regulator, GntR family  34.55 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379756 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0077  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0072  regulatory protein GntR HTH  39.29 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0074  transcriptional regulator, GntR family  39.29 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4277  regulatory protein GntR, HTH  40.74 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0058  regulatory protein GntR, HTH  39.47 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0486  transcriptional regulator, GntR family  38.68 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.78271 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0075  GntR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0073  GntR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0077  GntR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256514 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0072  GntR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04760  predicted transcriptional regulator  36.89 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0506039  normal  0.467802 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1332  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  37.74 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5187  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4863  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1108  transcriptional regulator  36.52 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0952489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4189  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  36.04 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0365  transcriptional regulator, GntR family  35.04 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4757  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  35.14 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  31.67 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3352  regulatory protein GntR HTH  30 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  38.46 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0185  GntR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0069  regulatory protein GntR, HTH  36.04 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  38.46 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2154  GntR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  34.55 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  34.55 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  34.55 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  36.36 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  35.45 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1007  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7289  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  41.1 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  41.03 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02920  predicted transcriptional regulator  34.62 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  37.04 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1337  transcriptional regulator, GntR family  32.71 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0676  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2712  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.902974  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2275  transcriptional regulator, GntR family  34.23 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00673812  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1515  regulatory protein GntR, HTH  31.82 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>