More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0168 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
133 aa  269  8.000000000000001e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  41.27 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  41.27 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  43.22 
 
 
126 aa  111  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
126 aa  110  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  43.22 
 
 
126 aa  110  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  41.53 
 
 
126 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  44.14 
 
 
125 aa  100  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  39.52 
 
 
126 aa  100  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
124 aa  98.6  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  38.6 
 
 
121 aa  98.2  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  42.61 
 
 
121 aa  97.8  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1629  transcriptional regulator, GntR family  35.59 
 
 
121 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1515  regulatory protein GntR, HTH  33.91 
 
 
120 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1279  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
125 aa  87.8  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00230471  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2337  transcriptional regulator, GntR family  40.71 
 
 
119 aa  87  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0365  transcriptional regulator, GntR family  35.65 
 
 
117 aa  83.2  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2000  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
118 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0169  transcriptional regulator, GntR family  38.74 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1621  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1108  transcriptional regulator  36.04 
 
 
122 aa  80.1  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0952489  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  40.23 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2285  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
118 aa  79  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0938  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2154  GntR family transcriptional regulator  45.21 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1919  transcriptional regulator, GntR family  32.46 
 
 
129 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  52.94 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  39.36 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  42.03 
 
 
131 aa  73.6  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  36.9 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 
129 aa  72  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1402  GntR family transcriptional regulator, putative  33.64 
 
 
125 aa  72  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2227  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  hitchhiker  0.00687189 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2235  GntR family transcriptional regulator  38.26 
 
 
117 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  38.94 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0185  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  40.3 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6591  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30942  normal  0.691161 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1122  transcriptional regulator, GntR family  36.47 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379756 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2547  transcriptional regulator, GntR family  32.69 
 
 
123 aa  67.4  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.136131  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1345  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117764  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  26.32 
 
 
117 aa  67  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1106  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 
125 aa  67  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.866665  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1243  transcriptional regulator, GntR family  36.62 
 
 
137 aa  67  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.157686  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0374  GntR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
118 aa  67  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  43.28 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  36.36 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  43.28 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  43.28 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  43.28 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  42.65 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2647  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423424  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  37.68 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  36.99 
 
 
119 aa  65.5  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3575  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00235324  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_002950  PG1007  GntR family transcriptional regulator  42.65 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1272  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3352  regulatory protein GntR HTH  40 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  44.78 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  30.68 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4757  transcriptional regulator, GntR family  29.57 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  38.3 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0960  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0882  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 
134 aa  63.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.905481  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0541  regulatory protein GntR HTH  38.03 
 
 
125 aa  62.8  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000336324  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0430  transcriptional regulator, GntR family  36.49 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1803  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0050  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
121 aa  62.8  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.898353  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
480 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0449  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
119 aa  62.4  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
480 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  31.01 
 
 
483 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  31.45 
 
 
480 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.68 
 
 
468 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  31.01 
 
 
480 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
480 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
480 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  31.01 
 
 
480 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02920  predicted transcriptional regulator  29.2 
 
 
119 aa  62.4  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  28.32 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  31.01 
 
 
480 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5187  transcriptional regulator, GntR family  41.79 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  31.45 
 
 
480 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0664  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
122 aa  61.2  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  30.34 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
321 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4866  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0251878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>